倒计时1天！时空组学及单细胞技术在肿瘤数据分析中的发现与应用线上研讨会

2022年7月21日下午14:00-16:00，深圳华大生命科学研究院联合华大智造、中国抗癌协会肿瘤标志专业委员，特举办“时空组学及单细胞技术在肿瘤数据分析中的发现与应用”线上研讨会，本次会议邀请哈尔滨工业大学张岩教授作开幕致辞/主持，深圳华大生命科学研究院吴靓副研究员、同济大学生命科学与技术学院王晨飞研究员作精彩报告。同时还邀请温州医科大学生物医学大数据研究所苏建忠教授、中山大学附属第一医院王芳教授进行前沿讨论。欢迎参加！

中国科学院大学基因组学博士，华中科技大学生物医学工程硕士。主要从事高通量单细胞技术平台开发、单细胞组学用于肿瘤异质性及微环境的研究。主导开发高通量单细胞样品制备平台3项，申请专利11项。发表SCI文章18篇，其中以第一作者／通讯作者（含共同）在Cell、 Nature Communications及Genomics， Proteomics & Bioinformatics 等期刊发表文章9篇。主持广东省青年基金1项。

原发性肝癌（简称“肝癌”）是世界上最常见的恶性肿瘤之一。我国每年新诊断的肝癌约占全球一半，其发病率在我国恶性肿瘤中位居第四位，死亡率第二位。单细胞及空间组学技术的具有高分辨度的优势。本次分享主要介绍单细胞及空间组学在肝癌的异质性及肿瘤微环境、尤其是肝癌转移复发研究中的应用。

同济大学生命科学与技术学院任特聘研究员。获得吴瑞奖学金、中国博士后创新人才支持计划、上海市科技启明星等荣誉。2012及2017年于同济大学生命科学与技术学院获得生物信息学学士、博士学位。2017-2020年分别在同济大学生命科学与技术学院、美国哈佛大学Dana-Farber癌症研究所从事博士后研究。

研究方向主要为开发单细胞多组学整合分析的生物信息学方法，研究细胞命运转变在肿瘤、发育及衰老相关疾病中的调控及作用。代表性研究工作包括开发了单细胞转录组与表观组整合分析方法MAESTRO，单细胞肿瘤免疫分析平台TISCH，空间转录组学精度提升算法STRIDE等。以第一/通讯作者身份在Nature、Nature Cell Biology、Cell Stem Cell、Genome Biology、Nucleic Acid Research、Cell Discovery 等杂志发表多篇研究论文。

Computational reconstruction of single-cell and spatial multi-omics

目前许多单细胞多组学技术只能生成单细胞的一种测序数据，缺乏有效的工具来整合多组学数据，以了解多层次的基因表达调控机制。同时，一些单细胞表观组学和空间转录组技术在实现单细胞分辨率方面存在技术限制。为了解决这些问题，我们开发了一系列的单细胞多组学数据整合工具。通过对单细胞多组学数据的整合和分析，能够深入研究复杂生物系统在空间、时间和多组学维度的基因调控机制。

1. SCRIPT，通过整合单细胞染色质开放数据(scATAC-seq)和转录因子结合数据（ChIP-seq），可以精确分析单细胞TF富集情况，识别细胞特异性TF及其下游的靶基因；

2. STRIDE，基于主题建模将空间转录组学的精度提高到单细胞分辨率，并利用高分辨率的空间转录组数据进行空间聚类和组织三维结构重建。

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