ATM机器究竟暗藏多少细菌？让RNA测序来告诉你
2016-11-21 生物通 薄荷 生物通 薄荷
比起在银行柜台排队取钱，使用自动柜员机（ATM）算是一种非常便捷的方式。不过，大家要小心，ATM可是暗藏了不少的细菌。近日，纽约大学的研究人员对纽约市多台ATM键盘上的细菌和真菌进行测序分析，发现了一系列微生物代表，不过总体多样性较低。
比起在银行柜台排队取钱，使用自动柜员机（ATM）算是一种非常便捷的方式。不过，大家要小心，ATM可是暗藏了不少的细菌。近日，纽约大学的研究人员对纽约市多台ATM键盘上的细菌和真菌进行测序分析，发现了一系列微生物代表，不过总体多样性较低。
纽约大学的Maria Gloria Dominguez-Bello和 Jane Carlton是文章的共同通讯作者。她们表示：“我们的结果表明，ATM键盘集合了不同来源的微生物组合，包括人类微生物组、食物上的真核生物以及潜在的新型极端微生物。从ATM上获得的DNA可记录人类行为和微生物的环境来源。”
研究小组于2014年6月和7月采集了纽约市曼哈顿、布鲁克林和皇后区的数十台ATM键盘上的细菌和真菌，包括4台室外机器，并利用Illumina MiSeq测序系统对66个拭子样品开展靶向的16S rRNA和18S rRNA测序。
研究人员从全部66个样品中鉴定出细菌序列，并从48个样品中鉴定出真核序列。他们发现了通常存在于人类皮肤上的放线菌、拟杆菌、厚壁菌和变形菌家族中的成员。不过，他们的分析并没有指出这些微生物的单一来源。相反，作者指出，室外空气和家庭表面，如厨房、洗手间、针头和电视，都是微生物最常见的栖息地。
研究团队进一步报告称，微生物群落的多样性相对有限，这可能反映了机器的定时清洁。例如，研究人员只检测到古细菌的9个可操作分类单元，但他们指出，利用引物来扩增16S rRNA序列可能丢失了一些古细菌的代表。变形虫及其他原生动物也相当有限。
研究人员还从ATM键盘上鉴定出一些真核的序列，它们似乎来源于ATM周边的食物，从用户手上转移到键盘上。在唐人街和法拉盛附近的几台ATM上，研究人员发现了与鱼类和软体动物相关的遗传标记。哈莱姆区的一台ATM上有着与鸡相关的序列，而在曼哈顿的机器中则藏着一种名为Xeromyces bisporus的真菌，似乎与烘焙食品有关。
作者写道：“尽管我们不能确定ATM键盘上X. bisporus的原始来源，但似乎有理由相信这种真菌是从处理过烘焙食物的人那里传过来的。特别是在曼哈顿这种交通枢纽地区，附近有许多便利店和咖啡馆出售这种类型的食品。”
原始出处：
Bik HM, Maritz JM, Luong A, Shin H, Dominguez-Bello MG, Carlton JM. 2016. Microbial community patterns associated with automated teller machine keypads in New York City. mSphere 1(6):e00226-16.
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学习了，以后要注意多洗手了
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谢谢分享！
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#RNA测序#
74
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68