Oncotarget：生殖干细胞中共表达及ceRNA网络相关的lncRNAs和circRNAs的表达谱
2017-09-16 MedSci MedSci原创
越来越多的证据表明，lncRNAs和circRNAs参与生殖细胞的发育。然而，关于lncRNAs和circRNAs在生殖干细胞的自我更新和分化中的功能和机制知之甚少。为此，本研究通过高通量测序探究了mRNAs、lncRNAs及circRNAs在雄性及雌性小鼠生殖干细胞的表达谱。结果共确定了生殖干细胞中18573种新的lncRNAs和18822种新的circRNAs，进一步通过RT-PCR证实这些l
越来越多的证据表明，lncRNAs和circRNAs参与生殖细胞的发育。然而，关于lncRNAs和circRNAs在生殖干细胞的自我更新和分化中的功能和机制知之甚少。为此，本研究通过高通量测序探究了mRNAs、lncRNAs及circRNAs在雄性及雌性小鼠生殖干细胞的表达谱。
结果共确定了生殖干细胞中18573种新的lncRNAs和18822种新的circRNAs，进一步通过RT-PCR证实这些lncRNAs和circRNAs的存在。结果表明，雄性和雌性生殖系干细胞具有相似的GDNF信号传导机制。接着研究显示，8115个mRNAs，3996个lncRNAs和921个circRNAs的表达具有性别差异。GO和KEGG通路富集分析显示，这些具有性别表达差异的circRNAs和lncRNAs的功能不同。
此外，研究人员还构建了相关表达网络，包括编码–非编码共表达和竞争内源性RNAs。共表达分析表明，成百上千的lncRNAs与小鼠的生殖干细胞的性别差异相关，包括lncRNA Gm11851、lncRNA Gm12840、lncRNA 4930405O22Rik和lncRNA Atp10d。CeRNA网络推测lncRNA MEG3和cirRNA Igf1r竞争性结合mirna-15a-5p从而增加靶基因Inha、Acsl3、Kif21b及Igfbp2的表达。
总之，这些研究发现为lncRNAs和circRNAs的研究提供了新的视角，并为进一步探究lncRNAs和circRNAs在生殖干细胞中的调节机制提供了基础。
原始出处：
Xiaoyong Li, Junping Ao, Ji Wu. Systematic identification and comparison of expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in mouse germline stem cells. Oncotarget. 2017 Apr 18; 8(16): 26573–26590. Published online 2017 Feb 25. doi: 10.18632/oncotarget.15719
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