BMC Genomics:研究揭示(+)-胆固醇-3-酮诱导的MSC成骨细胞分化中的miRNA-mRNA-lncRNA相互作用网络
2018-11-02 MedSci MedSci原创
我们先前的研究表明,(+)-胆固醇-3-酮(CN)具有诱导间充质干细胞(MSCs)成骨细胞分化的潜力。然而,CN在靶向miRNA-mRNA-lncRNA相互作用以调节成骨细胞分化中的作用仍然知之甚少。在CN诱导的MSC成骨分化期间,总共77种miRNA(36种上调和41种下调)和295种lncRNA(281种上调和14种下调)明显差异表达。生物信息学分析发现,几种通路可能在MSCs成骨分化中起重要
我们先前的研究表明,(+)-胆固醇-3-酮(CN)具有诱导间充质干细胞(MSCs)成骨细胞分化的潜力。然而,CN在靶向miRNA-mRNA-lncRNA相互作用以调节成骨细胞分化中的作用仍然知之甚少。
在CN诱导的MSC成骨分化期间,总共77种miRNA(36种上调和41种下调)和295种lncRNA(281种上调和14种下调)明显差异表达。生物信息学分析发现,几种通路可能在MSCs成骨分化中起重要作用,如维生素D受体信号传导,TNF信号传导,PI3K-Akt信号传导,钙信号传导和矿物质吸收通路。进一步的生物信息学分析揭示了16个核心基因,包括6个mRNAs(Vdr,Mgp,Fabp3,Fst,Cd38和Col1a1),5个miRNAs(miR-483,miR-298,miR-361,miR-92b和miR-155)和5个lncRNAs(NR_046246.1,NR_046239.1,XR_086062.1,XR_145872.1和XR_146737.1),其可能在调节CN诱导的MSCs的成骨分化中起重要作用。通过荧光素酶报告基因,AR-S,qRT-PCR和蛋白质印迹分析验证,我们鉴定了一种miRNA(miR-298),其可通过维生素D受体信号传导通路增强MSCs的成骨分化潜能。
总之,本研究首次揭示了miRNAs和lncRNAs参与中药有效成分CN诱导成纤维细胞分化的全球表达谱,为今后miRNA-mRNA-lncRNA相互作用网络的研究奠定了基础,以完全阐明了CN在MSCs成骨细胞分化中的调控作用。
原始出处
Qiuke Hou, Yongquan Huang, et al., Profiling the miRNA-mRNA-lncRNA interaction network in MSC osteoblast differentiation induced by (+)-cholesten-3-one. BMC Genomics. 2018; 19: 783.
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