F1000基因组学和遗传学七大新闻(2011.9.15)

HIV从细胞膜出芽生长，图片来自维基共享资源

1. RNA荧光标记
一种用来标记和追踪活细胞中RNA过程的新技术，有望像绿色荧光蛋白(GFP)开启蛋白质研究那样打开RNA生物学研究。这种标记方法由结合到GFP类似荧光素的短RNA序列组成，能够产生很多颜色的荧光。这些RNA-荧光素复合物然后能够融合到细胞中的RNA分子。
J.S. Paige et al., “RNA mimics of green fluorescent protein,” Science, 333:642-46, 2011.

2. 意外发现新的分子伴侣Spy
研究人员在测试基因工程菌大肠杆菌在体内使得不稳定的蛋白质稳定化的能力的过程中，偶然间发现一种新的蛋白分子伴侣Spy，而且该分子伴侣能够抑制蛋白聚集并辅助蛋白重折叠。Spy的塑造不同于其他任何以前研究过的分子伴侣，它能够多达700倍地增加一组不稳定的蛋白突变体的稳态水平。
S. Quan, et al., “Genetic selection designed to stabilize proteins uncovers a chaperone called Spy,”Nat Struct Mol Biol, 18:262-69, 2011.

3. 全局基因表达
采用一种称作平行代谢脉冲标记(parallel metabolic pulse labeling)的技术，研究人员测量了5000多个哺乳动物基因的mRNA和蛋白丰度及其周转速度，因而也是迄今为止第一次在基因组范围内预测mRNA和蛋白质的合成速率。这些结果表明细胞中的蛋白质丰度主要是在转录水平进行调控的。
B. Schwanhäusser et al., “Global quantification of mammalian gene expression control,” Nature, 473:337-42, 2011.

4. DNA为何断裂
染色体不稳定性---基因组中某些位点在复制压力下倾向于发生断裂---能够导致肿瘤发生。以前的研究表明这种常见的脆弱位点倾向于产生断裂，因为在复制期间产生的二级结构阻止复制叉形成。相反，这篇研究表明至少一个位点FRA3B甚至在很少有复制事件启动的时候也是不稳定的，这就意味着肯定存在另一种机制导致这个位点的脆弱性。
A. Letessier et al., “Cell-type specific replication initiation programs set fragility of the FRA3B fragile site,” Nature, 470:120-23, 2011.

5. 奇特的大西洋鳕免疫机能
大西洋鳕(Atlantic cod)全部基因组序列揭示这种鱼已丢失两种在免疫性能上发挥关键作用的MHCII和CD4基因。明显是作为补偿，这种鳕基因组显示MHCI基因座位得到极大地扩增，含有独特的一套Toll样受体---免疫系统中另一种重要的组分。
B. Star et al., “The genome sequence of Atlantic cod reveals a unique immune system,” Nature, 477:207-10, 2011.

6. 逃避自然杀伤细胞导致的死亡
就像T细胞能够给HIV施加压力让它适应逃避识别，现在自然杀伤细胞似乎也能驱使HIV进化。研究人员在HIV-1毒株中鉴定出多态性，以便阻止特异性自然杀伤细胞免疫球蛋白样受体(killer immunoglobulin-like receptor, KIR)激活该杀伤细胞。
G. Alter et al., “HIV-1 adaptation to NK-cell-mediated immune pressure,” Nature, 476:96-100, 2011.

7. 细胞年轻的分子源泉？
复杂性有机体的细胞有能力从根本上复位它们的年龄，是通过细胞分裂成配子(gamete)的方式进行的，而且这些配子会相互结合产生新的有机体。如今，研究人员已确定至少一种分子组分---酵母NDT80基因---使得这种能力成为可能。在没有正在进行配子发生的酵母细胞中短暂表达NDT80基因也能够使得它们的寿命复位。
E. Unal et al., “Gametogenesis eliminates age-induced cellular damage and resets life span in yeast,”Science, 332:1554-47, 2011.

F1000基因组学和遗传学七大新闻 (Top 7)是为期30天的F1000基因组学和遗传学领域成员们于2011年9月15日计算出来的基因组学和遗传学及其相关领域方面的评级最高的论文的简要总结。F1000成员们在他们的研究领域对最重要的论文作出评价并评级。如果想要去看看最新的评级情况，可以搜索数据库，阅读每天的评价结果，具体情况访问http://f1000.com。（生物谷Bioon.com：towersimper编译）

本文译自Sabrina Richards, The Scientist, "Top 7 in Genomics & Genetics", September 19, 2011。