Clin Chem：在细菌性阴道病背景下检测加德勒菌基因种
2019-12-23 MedSci MedSci原创
虽然阴道加德纳菌是细菌性阴道病的病原体之一，但其也可以从健康女性的阴道中分离出来。
虽然阴道加德纳菌是细菌性阴道病的病原体之一，但其也可以从健康女性的阴道中分离出来。以前对阴道加德纳菌的研究发现了4到6个分支，但平均核苷酸分析表明阴道加德纳菌可能包括多个物种。最近，研究表明加德勒氏杆菌包括13个基因种，其中piottii、leopoldii和swidsinkii为单独的种。
研究人员获得了了103个标注为阴道加德纳菌的公开可用基因组。进行了全面的分类和系统基因组分析，以量化阴道加德纳菌的物种数量，它们的核心基因的相似性，以及它们的附属基因的结构载量。此外，还分析了公开的关于细菌性阴道病的宏转录组数据集，以确定新描述的基因组特异性是否存在，并确定阴道加德纳菌的保守特征。
研究发现，根据电脑预算阴道加德纳菌分为8 ~ 14个基因组种。一致分类鉴定了9种不同的加德勒菌基因组特异性，这里分别注释为GS01到GS09。通过共享基因的系统发育和副基因的载量，可以很容易地区分基因组种。所有的新基因种都是在细菌性阴道病元基因组中发现的。
研究结果表明，阴道加德纳菌基因组单独或协同作用可能是导致细菌性阴道病的原因。这些结果对于理解加德勒菌基因组的进化、宿主与病原体在细菌性阴道病期间的相互作用、细菌性阴道病诊断试验的发展以及阴道微生物组的元基因组研究具有重要的意义。
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