Nature：重要论文修正癌症研究前论

Weill Cornell医学院的研究人员在尝试去验证以往报道的关于三阴性乳腺癌的一个分子发现（许多人曾满怀希望该研究发现可以促使开发出针对这种侵袭性癌症的靶向疗法）时，转而证实了这一研究结果只限于一名患者，而无法应用于进一步的临床研究工作。这一发表在4月15日Nature杂志上的研究发现修正了早期的研究工作，并强调了独立研究验证和小心研发实验方法的重要性。

这一由麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院的研究人员发表在2012年6月的Nature杂志上的研究工作，发现一种融合基因存在于少数但也具相当数量的三阴性乳腺癌患者肿瘤样本中（延伸阅读：Nature：癌症的多个驱动子 ）。三阴性乳腺癌是一种特别致命的乳腺癌亚型，通常没有好的治疗方法可供选择。原来的研究小组推断，MAGI3-AKT3融合基因可以为药物开发提供一个新的分子靶点。

在这项研究发布后不久，由Mark A. Rubin、Sandra J. Shin和Juan Miguel Mosquera博士领导的Weill Cornell医学院研究小组，开始着手去确定在Weill Cornell医学院自己收集的三阴性乳腺癌样本中是否存在这一融合基因以及其发生的频率。

论文的共同资深作者、Weill Cornell医学院精准医学研究所主任Rubin博士说：“大型基因组研究报告了大量的新突变数据，但一些却欠缺验证。”

他们开发了一种基于组织的检测方法来揭示MAGI3-AKT3融合基因阳性样本，这种方法通常用于开发生物标志物，却惊讶地发现没有一个Weill Cornell医学院的样本显示这一突变阳性。

“一些受人尊敬的研究人员发现了MAGI3-AKT3融合基因，并将它发布在顶级期刊上，给人们带来了极大的希望，让他们兴奋地认为开发出了一种针对三阴性乳腺癌的新治疗靶点，”论文的共同资深作者、Weill Cornell医学院病理学和实验室医学副教授Shin博士说。

Weill Cornell医学院病理学和实验室医学助理教授Mosquera博士说：“我们阐明了除了一个病例之外，最初报道的突变不经常发生，是一个假象。我们的研究工作强调了在这种情况下病理学对于验证至关重要。最初的研究发现必须获得承认并进行修正。”

为了充分确定MAGI3-AKT3融合基因研究发现无效，该研究小组经历了一个漫长的过程，一开始筛查了150多个内部的样本。他们本来预计和原始Nature论文一样将发现7%的样本包含这种融合基因，但却发现没有一个匹配。他们注意到2012年研究的那些原始肿瘤并不是在基因组水平上证实具有这一改变。相反原来的研究小组是对RNA进行了一种筛查测试，基于这些研究结果认定其他的肿瘤也具有这一突变。

Weill Cornell医学院小组进一步对来自癌症基因组图集和苏黎世大学医院的另外100多个样本进行了测试，他们也没能在这些病例中证实原来的研究结果。

大约在2年前，他们将研究结果告知了Nature杂志和Broad研究所的研究人员，让这些研究人员重新分析他们的72名患者样本，加另外370个乳腺肿瘤。当Broad研究所的研究人员回过头在DNA水平上重新测试这些样本时，他们发现这种基因融合只存在于第一个启动这一长期研究的病例中，使得它成为了一个不适于未来开发临床试验的孤立研究发现。

Weill Cornell研究小组认为，在这些结果发布之前本应该在基因组水平上对发现的MAGI3-AKT3融合基因进行验证。

Shin博士说：“知道我们的研究结果将节约很多研究人员为实现最终无法达到的目标要付出的时间、努力和资源，我们感到很高兴。并且同样重要的是，它使得一些患者可以避免参与不可能生成阳性结果的临床试验。”

原始出处：

Juan-Miguel Mosquera,Sonal Varma,Chantal Pauli, Theresa Y. MacDonald,Jossie J. Yashinskie,Zsuzsanna Varga,Andrea Sboner,Holger Moch,Mark A. Rubin& Sandra J. Shin. MAGI3–AKT3 fusion in breast cancer amended.Nature, April 16, 2015, 520, E11-E12.doi:10.1038/nature14265

Shantanu Banerji,Kristian Cibulskis, et al.Sequence analysis of mutations and translocations across breast cancer subtypes.Nature, June 21, 2012, 486:405–409. doi:10.1038/nature11154