Hiplot:一个免费和全面的生物信息学科学计算和可视化云平台
2021-10-28 MedSci原创 MedSci原创
一般来说入门的作图软件类似:graphpad,origin这种的。可以满足大多数我们作图的需求,但是有一些特殊的图,可能就需要更专业的作图软件来完成了。
一般来说入门的作图软件类似:graphpad,origin这种的。可以满足大多数我们作图的需求,但是有一些特殊的图,可能就需要更专业的作图软件来完成了。
随着图形美化的需要越来越多,所以也就会出现很多在线作图的平台。正好最近有一个作图平台开放使用了,所以今天就来介绍一下这个集合了作图和一些基本分析的平台:Hiplot (https://hiplot.com.cn/),这里进行相关介绍,希望梅斯医学的会员们也可以喜欢。
1、简介
Hiplot(https://hiplot.com.cn)是基于 Web 技术开发的一个免费和综合的科学数据计算和可视化云平台。它由 openbiox 开源社区支持和运维。与其他类似平台相比,Hiplot 提供了一种更为简洁的网页和命令行交互方式。
可编辑的表格视图和切换的文件上传功能简化了大多数任务的数据加载过程。 数据,参数和任务历史记录均可以通过 JSON 格式文件进行导入和导出,以增强任务的可重现性。单个 R 语言脚本或函数就可用于生成 Hiplot 工具插件的网页前端、命令行接口以及工具的描述信息。到目前为止,Hiplot 上已有数百个免费应用程序在提供服务,包括基本的统计描述,预测模型,多组学数据分析和文本挖掘等。
--- Hiplot Team
2、主要功能
其基础模块和进阶模块涵盖热图、主成分分析、矩阵气泡图、火山图、韦恩图、Go气泡图、Hi-C热图、弦图、小提琴图、世界/中国地图等常用功能,也支持在线blast、SRA数据下载、GO/KEGG富集分析、甲基化数据分析、基因通路表达分析、进化树可视化、地图数据可视化、基因差异表达可视化、基因共表达网络分析,解刨医学图绘制、曼哈顿图可视化、GWAS可视化、开源流程图绘制(Drawio)、交互式宏基因组数据分析、PCA聚类等,几乎涵盖了常见的所有科研绘图功能。
3、小工具
支持拼图,PDF文本提取,Pubmed文本提取等,并附带R相关开源书籍在线浏览
4、其他
开发团队在哔哩哔哩网站上发布了使用教程及开发教程
https://www.bilibili.com/video/BV1Qz4y1r7up?zw
支持Windows/Mac/Linux本地版本
相关网站:https://hiplot.com.cn/
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在此留言
#Hiplot#,搞一个专门的社区,一起讨论
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Openbiox Hiplot (ORG) 最新访问地址:https://hiplot.cn
120
#可视化#
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#生物信#
121
厉害
180
谢谢分享
174
上交大同学弄的,厉害
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