Radiology:高大上的影像基因组学在非小细胞肺癌的应用!
2017-07-25 shaosai MedSci原创
影像基因组学是近年来蓬勃发展的一门新兴学科,国内外大部分文献报道集中在近五年。它将影像学和遗传学结合起来,用以研究不同基因型的病变的差异。
影像基因组学是近年来蓬勃发展的一门新兴学科,国内外大部分文献报道集中在近五年。它将影像学和遗传学结合起来,用以研究不同基因型的病变的差异。
本研究共纳入了自2008年4月至2014年9月113例诊断为NSCLC患者,并对CT和肿瘤组织资料进行分析。
对于每一处肿瘤,以为胸部放射学医师记录87种语义图像特征,选择能够反映结节形态、边界、纹理、肿瘤周围组织关系和整个肺的影像学特征。然后将所有肿瘤组织中的RNA成分分离出,并利用RNA序列技术进行分析。
10种高度相关表达的基因簇被发现,并命名为转位基因。该基因在基因谱中得到验证,其与肿瘤的预后相关。随后,利用T检验和Spearman相关分析并经过多重检验验证得到影像基因组学图,将语义影像学特征和转位基因联系起来。
本研究结果为RNA序列分析结果为有10种转位基因控制着各种分子通路,包括表皮生长因子(EGF)通路。影像基因组学图包括了32种影像学特征与转位基因间的相关性,并有统计学意义。例如,结节密度模糊和边界与晚期细胞周期基因相关,与EGF通路相关的转位基因与磨玻璃影、不规则结节和边界模糊的结节具有相关性。
本研究表明,NSCLC影像基因组学分析影像学特征与转位基因间存在着多重相关性,该类基因代表在相应的分子通路,从而能够非侵入性的分析NSCLC的分子学特征。
原始出处:
Mu Zhou, Ann Leung, Sebastian Echegaray, et al. Non-Small Cell Lung Cancer Radiogenomics Map Identifies Relationships between Molecular and Imaging Phenotypes with Prognostic Implications.Radiology. 2017.DOI: 10.1148/radiol.2017161845
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