Gut：ZNF365亚型D的变异型与克罗恩病相关
2011-07-29 MedSci原创 MedSci原创
最近，美国学者Talin Haritunians等，进行了一项全基因组关联研究，确定了多个克罗恩病（CD）易感基因位点，包括与10q21的非编码基因间单核苷酸多态性（SNP）相关。结果表明，非同义的Ala62Thr SNP，rs7076156构成了10q21与CD风险相关的基础的假说，并说明这种SNP在ZNF365亚型D的控制下，通过改
最近，美国学者Talin Haritunians等，进行了一项全基因组关联研究，确定了多个克罗恩病（CD）易感基因位点，包括与10q21的非编码基因间单核苷酸多态性（SNP）相关。结果表明，非同义的Ala62Thr SNP，rs7076156构成了10q21与CD风险相关的基础的假说，并说明这种SNP在ZNF365亚型D的控制下，通过改变这些基因的表达来发挥作用。该项研究发表在《胃肠道》（Gut）上。 为了精确描绘10q21位点，研究者们对1632例CD和961例对照中的86个SNP进行了基因型描述，并使用罗杰斯（logistic）回归进行单一标记和条件分析。 与CD危险性相关的基因横跨了11个SNP（p＜0.001）。观察到的最显著的相关性，为位于非同义的SNP，rs7076156（Ala62Thr）。丙氨酸等位基因在CD中表现过多（p=5.23×10−7；OR=1.39（95% CI 1.22 到1.58））；等位基因频率在CD中为76%，在对照中为69.7%。对rs7076156的条件分析使其他的显著相关均作废，说明它是这一位置的致病变异型。ZNF365的四种亚型已被确认，rs7076156位于ZNF365亚型D的一个特异性外显子上。作者使用逆转录PCR证实，ZNF365D在切除肠道中的表达，同时来源于CD受试者和对照。在来源于CD受试者的风险等位基因（Ala）的纯合子的EB病毒转化的淋巴样干细胞系中，发现ZNF365D平均表达水平显著降低。一个全基因组芯片表达研究进一步表明，ZNF365亚型D的Ala62Thr改变与CD 中ARL4A, MKKS, RRAGD, SUMF2, TDR1 和ZNF148基因的差异表达相关。 相关内容：Variants in ZNF365 isoform D are associated with Crohn's disease
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