Gene:KDM6A基因中的一个16bp插入/缺失显示出与山羊生长性状的强烈关联
2018-11-13 MedSci MedSci原创
赖氨酸去甲基化酶6A(KDM6A)作为与骨骼发育不良和成骨分化相关的候选基因,可能影响动物的生长性状。在先前的研究中,KDM6A基因内的一个16bp内含子插入/缺失(NW_017189516.1:g.138,431_138,446delAATGTATAGCTTAAAA)显著影响KDM6A基因的表达。本研究旨在探究这个16bp插入与陕西白绒山羊(SWCG)生长相关性状之间的关联。 结果关联分析
赖氨酸去甲基化酶6A(KDM6A)作为与骨骼发育不良和成骨分化相关的候选基因,可能影响动物的生长性状。在先前的研究中,KDM6A基因内的一个16bp内含子插入/缺失(NW_017189516.1:g.138,431_138,446delAATGTATAGCTTAAAA)显著影响KDM6A基因的表达。本研究旨在探究这个16bp插入与陕西白绒山羊(SWCG)生长相关性状之间的关联。
结果关联分析显示,16bp indel与SWCG人群中的生长性状强度(身高、胸深、髋部高度、体长和胸围)有关(n = 1953,P <0.05)。插入/插入(II)基因型个体(n = 1502)具有最佳的生长性状,通过比较插入/缺失(ID)(n = 410)和缺失/缺失(DD)基因型(n = 41)。特别是,II基因型个体的体重明显高于ID和DD基因型(P <0.01)。此外,这种插入物对性状的明显影响可能是由MEF2结合位点的变化引起的。
总之,这些发现暗示KDM6A基因中的16bp缺失突变与生长相关性状显著相关,可以指定为山羊育种中生长性状的有效分子标记。
原始出处:
Wang K, Cui Y, et al., One 16 bp insertion/deletion (indel) within the KDM6A gene revealing strong associations with growth traits in goat. Gene. 2018 Nov 5;686:16-20. doi: 10.1016/j.gene.2018.11.010.
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