PLON ONE:使用微滴数字PCR 对四种人疟原虫进行定量检测
2017-05-12 MedSci MedSci原创
微滴数字聚合酶链反应(ddPCR)是基于水-油乳液微滴技术的微滴技术。它是一种用于检测和描绘复杂背景的次要等位基因的高灵敏度方法,并且能够提供靶标DNA的绝对定量。ddPCR技术已经被应用于多种病原体的检测。
近日,国际杂志PLOS ONE上在线发表一项关于采用数字PCR对疟原虫进行检测的评价性研究。
微滴数字聚合酶链反应(ddPCR)是基于水-油乳液微滴技术的微滴技术。它是一种用于检测和描绘复杂背景的次要等位基因的高灵敏度方法,并且能够提供靶标DNA的绝对定量。ddPCR技术已经被应用于多种病原体的检测。本文研究了利用ddPCR检测和对疟原虫种定量的敏感检测方法。该测定方法被开发用于两个水平的检测,即为所有疟原虫种属特异性和种特异性检测。该ddPCR测定是基于疟原虫属18S rRNA基因的特定引物探针。使用ddPCR超敏感对恶性疟原虫评估,从1mL血液样品获得的浓缩DNA中可以检测到的低至11个寄生虫/ mL。对于物种鉴定,特别是对于具有混合感染的样品,开发了用于检测和定量恶性疟、间日疟、卵形疟和三日疟的双相反应。在双相反应中每个疟原虫种的扩增显示出与单一物种检测相同的敏感性。双相ddPCR检测方法在对柬埔寨32种亚临床寄生虫血症样本中具有更高的敏感性,并且性能优于实时PCR。
研究表明,ddPCR对评估所有人类疟原虫种的非常低的寄生虫血症中均显示出较高灵敏度。这为在消除疟疾地区研究无症状寄生虫宿主在传播的作用提供了一个有用的研究工具。
原始出处:
Suttipat Srisutham, Naowarat Saralamba,
Benoit Malleret. et.al. Four human Plasmodium species quantification using
droplet digital PCR. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0175771
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