Nature子刊：北京大学郭雪峰/北京科技大学李立东合作开拓新的方法，为未来精确的单分子测序奠定了技术基础
2023-02-07 iNature iNature 发表于上海
这种方法能够有效地区分给定RNA序列中的不同核苷，从而为未来精确的单分子测序奠定了技术基础。
RNA的降解过程在保证生物体内遗传信息的高保真翻译中起着决定性作用。然而，实时可视化单碱基降解过程并在单酶水平上破译降解机制仍然是巨大的挑战。
2023年2月1日，北京大学郭雪峰及北京科技大学李立东共同通讯在Nature Communications在线发表题为“Single-exonuclease nanocircuits reveal the RNA degradation dynamics of PNPase and demonstrate potential for RNA sequencing”的研究论文，该研究表明单核酸外切酶纳米回路揭示了PNPase的RNA降解动力学，并展示了RNA测序的潜力。
该研究提出了一种可靠的基于超高时间分辨率的硅纳米线场效应晶体管的原位单PNPase分子动态电探测器。这些设备能够以单碱基分辨率实现RNA类似物降解的实时和无标记监测，包括RNA类似物结合、单核苷酸水解和单碱基移动。作者发现了酶(在活性位点附近)与核苷的结合事件，进一步理解了RNA降解机制。依靠对独立读段的系统分析，在RNA核苷测序中，大约80%的准确性在单个测试过程中实现。这一概念验证为机械探索和单分子测序的高通量检测技术的发展建立了一个互补金属氧化物半导体(CMOS)兼容的平台。
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