盘点：蛋白质组学助力精准医学的发展

2015年巴拉克奥巴马总统对国会发表的国情咨文中提出国家癌症登月计划，计划2016年投入10亿美元到该计划中，主要聚焦在免疫治疗，基因组学和联合治疗等几个方面。来自Inova Schar癌症研究所的Thomas P. Conrads与乔治梅森大学的Emanuel F Petricoin共同发表了这篇最新文章，希望人们对于蛋白质组学在精准医学，特别是癌症中的重要性投入更多关注。虽然对于癌症登月计划表示十分赞同，但是他们认为这项计划不应仅以基因组学为重点，蛋白质组学也是非常重要的一个方面。

毕竟基因组只进行信息的存档，蛋白质才是真正执行细胞活动的执行者。并且蛋白质构成了大多数用于癌症检测的生物标记物，还组成了驱动免疫应答以及细胞内外信息交流的抗原，除此之外，几乎每种靶向治疗方法都以蛋白质为靶向目标。因此蛋白质应当成为癌症登月计划的一个重要研究方向。这里梅斯小编整理了近期关于蛋白组学的研究进展与大家一同分享。

【1】利用蛋白组学分析对双边突发性感觉神经性听力损失自身免疫病理证据的鉴定

发性感觉神经性听力损失（S-SNHL）是一种内耳障碍，并且在3天之内发生突发性的听力损失。然而，到目前为止，该病的病理机制仍旧不清楚，尽管在假设的病因中，自身免疫被认为是其中一个病因，尤其是在双边听力损失中。最近，有研究人员利用蛋白组学方法旨在为自身免疫参与了双边S-SNHL提供证据，该研究发现，自身免疫的确参与了双边S-SNHL的发生。另外，研究人员还调查出了循环自身抗体和候选抗原的存在。最后，研究人员指出，这些发现可以为诊断生物标记的开发提供必要的基础证据，并且可以帮助人们理解双边S-SNHL的病理学机制。

【2】中国儿童早期龋损发展中唾液蛋白组学概况的纵向调查研究

近日，新的一项研究调查分析了3-4岁儿童早期龋损（ECC）发展过程中唾液内不同的肽表达。研究对82名未罹患龋坏的儿童随访观察1年。刺激腺体分泌，分别在0、6和12个月时收集受试者全部唾液进行分析。结果显示，在3个时间节点，组C中有9个肽的峰值与其他存在明显差异，这可能与龋损的发展有一定的关联。在这9个肽中，有3个随着时间的推移表达水平升高，另外6个逐渐降低。研究者们从中选择3个最能表现出其功效的肽(1346.6， 2603.5和3192.8 Da)，以此来构建儿童患龋的高风险模型。其中1个肽(1346.6Da)经鉴定为唾液中的富含脯氨酸肽。表明应用肽组学的方法可以帮助识别和发现在ECC发生和发展过程中新的生物标记物。

【3】利用无标签LC-MS/MS蛋白组学方法鉴定蛋白生物标记和信号通路与抗放射性前列腺癌的联系

生物标记和信号途径的鉴定对抗辐射性前列腺癌（CaP）的控制是重要的。最近，有研究人员对蛋白生物标记和信号通路与抗放射性前列腺癌的联系进行了研究。结果发现，在CaP-RR细胞系中，ALDOA的缺失结合放射疗法能有效地减少群体的形成，并且诱导更多的细胞凋亡和增加了辐射敏感性。最后，研究人员指出， CaP辐射抗性是由多因子的特性引起的，ALDOA表达的下调可以增加CaP-RR细胞的辐射敏感性，并表明了控制这些鉴定的蛋白或者信号途径并且结合放射疗法也许可以克服CaP细胞的抗放射性。

【4】在热激蛋白90调控抑制的膀胱癌疗法中，蛋白组和组蛋白翻译后修饰的蛋白组学分析

热激蛋白90（HSP90）的抑制作用的利用是一个非常诱人用于癌症治疗的策略。一些HSP90抑制剂在临床肿瘤试验中展现了很有应用前途的效果。然而，关于HSP90调控抑制的膀胱癌疗法的机制所知甚少。最近，研究人员报道了一个数量蛋白组学研究，即当蛋白表达量的改变和组蛋白翻译后修饰（PTMs）改变时，膀胱癌对HSP90抑制作用响应的评估。研究展示了5种HSP90抑制剂（AUY922， ganetespib， SNX2112， AT13387， 和CUDC305）显着地抑制了膀胱癌5637细胞的增殖，并呈现剂量和时间依赖的模式。在AUY922和ganetespib处理的5637细胞中，研究人员利用数量蛋白组研究方法，在核心组蛋白93个标记中鉴定了14种类型的PTMs，并且包括丁酰化、瓜氨酸化、二羟基异丁酰化、甲基化、 糖基化修饰、丙酰化和琥珀酰化的34个新的组蛋白标记。