重现50篇高水平癌症论文的计划缩减至18篇
2018-08-10 佚名 中国生物技术网
五年前，科学家们启动了一个雄心勃勃的项目，计划将50篇具有影响力的癌症生物学论文中的实验复制。但遗憾的是，该计划的数字正在逐渐缩减，现在预计尽完成其中18项研究。
五年前，科学家们启动了一个雄心勃勃的项目，计划将50篇具有影响力的癌症生物学论文中的实验复制。但遗憾的是，该计划的数字正在逐渐缩减，现在预计尽完成其中18项研究。
美国弗吉尼亚州Charlottesville开放科学中心的生物学家Tim Errington说：“我希望我们能做得更多，但是直到我们着手做这个项目的时候，才发现其中很多问题非常具有挑战性。”
这个项目名为“再现计划：癌症生物学（简称RP:CP）”，于2013年10月启动。这是一个测试实验可再现性的开放研究，起因是两家药物公司报告称它们无法将很多癌症研究的成果再现。这项研究的合作方之一是位于美国加州Palo Alto的Science Exchange公司。该公司找到了委讬实验室来重现论文中的一些关键实验。Laura和John Arnold基金会资助了130万美元，相当于每项研究有2.5万美元的经费。实验预计花费一年时间。
该项目很快引起了论文原作者的批评，他们担心这些复制性研究将不可避免地失败，因为委托实验室缺少重现这些实验的专业能力。
随着花费的增加和项目的延期，这个项目的组织者们意识到他们需要从原作者那里获取更多的信息和材料，他们还决定让这些重现实验接受同行评议，而这又增加了时间。在2015年末，组织者们将论文数量削减到37篇。2017年时，再次削减到29篇。在过去的几个月中，他们决定停止对正在进行的11项研究复制。（Science Exchange公司的主席Elizabeth Iorns说，这18项研究平均每项需要花费6万美元，其中包括两个花费异常高的项目。）
Errington说，削减这些研究数量的原因之一是，需要花费太长的时间来解决问题和优化实验才能得到有意义的结果。比如，确定适用于实验的细胞密度需要测试一系列细胞密度。尽管这些事情在实验室中很正常，但是如果原论文中包含这方面的方法论详细细节，那么这个过程就会快得多。这个项目还花费了大量的时间来获取或重新制备试剂，比如细胞系和质粒（插入细胞中的DNA），这些试剂是原始实验室无法获得的。
从这项研究中获取的教训之一：公开更多的研究记录细节，并能直接从原实验室免费获取材料，或者得到类似Addgene的服务，可以加快科学家们重现他人研究工作的进度。Errington说：“沟通和分享是我们可以更容易实现目标的方法。”Iorns补充说，另一个问题在于，学术界的实验室很少验证他们的论文，这使得我们很难确定阳性结果是正确的还是错误的。
对这18项研究的重现已经有10项发表在《eLife》上。研究结果各不相同，其中5项实验大部分可重现，3项实验结果不确定，还有2项实验得到了负面结果，但是最初的研究成果已经得到了其他实验室的确认。事实上，正如RP:CB的批评者所指出，最初计划重现的这50篇论文中的大部分都已经被其他的研究团队证实过。
RP:CB的团队正在详细描撰写剩余8项已完成的研究，以及该项目的元分析和总结。其余11项未完成的研究也将以简短的形式发表。Errington说，这些研究虽然不如完成的重现实验，但也是具有很多价值的。
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