Onco Targets Ther：研究揭示与乳头状肾细胞癌预后相关的分子机制
2017-09-04 MedSci MedSci原创
乳头状肾细胞癌（PRCC）是肾细胞癌的第二个常见的亚型，其治疗和预后缺乏有效的治疗靶点和分子标志物。越来越多的研究关注长链非编码RNAs（lncRNAs）——可以作为竞争性内源性RNA（ceRNA）来竞争microRNAs（miRNAs），在人类肿瘤发生的中的作用。因此，为阐明lncRNA在PRCC中介导ceRNA网络的作用，研究人员全面整合了来自The Cancer Genome Atlas数据
乳头状肾细胞癌（PRCC）是肾细胞癌的第二个常见的亚型，其治疗和预后缺乏有效的治疗靶点和分子标志物。越来越多的研究关注长链非编码RNAs（lncRNAs）——可以作为竞争性内源性RNA（ceRNA）来竞争microRNAs（miRNAs），在人类肿瘤发生的中的作用。
因此，为阐明lncRNA在PRCC中介导ceRNA网络的作用，研究人员全面整合了来自The Cancer Genome Atlas数据库的289个PRCC和32个正常组织中全转录组表达谱数据，包括mRNAs、lncRNAs和miRNA。
结果，研究人员确定了2197个差异表达的mRNAs (DEmRNAs)和84个差异表达的miRNAs (DEmiRNAs)（| log2|阈值> 2，p＜0.05）。为确定枢纽关键靶基因DEmRNAs，研究人员分析加权基因共表达网络。确定了28个枢纽DEmRNAs为潜在的靶基因。
鉴定了7个DEmRNAs失调与28个枢纽潜在的靶基因显著相关。此外，研究发现了16个差异表达的lncRNA，可与DEmiRNAs相互作用。最后，研究人员利用Cytoscape软件观察这些差异表达分子的ceRNA网络。
总之，该研究确定了ceRNA网络在PRCC恶化的过程中起着至关重要的作用，并确定了一些与临床预后密切相关的基因。
原始出处：
Chuiguo Huang, Naijun Yuan, Liying Wu, et al., An integrated analysis for long noncoding RNAs and microRNAs with the mediated competing endogenous RNA network in papillary renal cell carcinoma. Onco Targets Ther. 2017; 10: 4037–4050. Published online 2017 Aug 14. doi: 10.2147/OTT.S141951.
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