Oncotarget：COL3A1过表达或与膀胱癌预后差相关。
2017-10-27 fengxiangxin MedSci原创
在此研究中，研究者构建了加权基因共表达网络，以鉴定与BCa（n = 93）进展相关的基因模块。在重要模块（R（2）= 0.48）中，共鉴定出103个网络hub基因，其中4个同时是蛋白质 - 蛋白质相互作用网络中的中枢节点。
膀胱癌（BCa）是世界范围内男性和女性中高发的癌症之一，其病因和机制尚不清楚。
在此研究中，研究者构建了加权基因共表达网络，以鉴定与BCa（n = 93）进展相关的基因模块。在重要模块（R（2）= 0.48）中，共鉴定出103个网络hub基因，其中4个同时是蛋白质 - 蛋白质相互作用网络中的中枢节点。
在验证中发现，与测试组hub模块中的任何其他hub基因相比，COL3A1显示出与疾病进展更高的相关性（p <0.001）。基因功能和通路富集分析表明，COL3A1在焦点黏连通路中过表达，这与肿瘤进展相关并可能导致肿瘤转移。基因组富集分析（GSEA）也表明，COL3A1高度表达的BCa样品中富集了“MAPK信号通路”基因集和焦点粘附相关通路（FDR <0.05）。
联系临床病理参数发现：COL3A1高表达与局部复发和BCa分期密切相关。生存分析显示，COL3A1表达较高的BCa患者的总生存时间和无病生存时间均明显缩短。
总之，基于共表达分析，鉴定出COL3A1与BCa进展和预后相关。它对MAPK信号通路的调节可能与不良预后相关。
原始出处：
Yuan L， Shu B， Chen L.et al.Overexpression of COL3A1 confers a poor prognosis in human bladder cancer identified by co-expression analysis.Oncotarget. 2017 Jul 28；8(41)：70508-70520. doi： 10.18632/oncotarget.19733. eCollection 2017 Sep 19.
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