Clinical Translational Gastroenterology： DNA甲基化特征的鉴定及其在克罗恩病中的临床价值
2019-12-11 不详 MedSci原创
DNA甲基化是调节基因表达的表观遗传机制，代表了基因型，环境和疾病之间的重要联系。这是一种可逆和可遗传的机制，也许可以为治疗某种疾病提供目标。本项研究旨在评估以前与克罗恩病（CD）相关的特定基因的甲基化变化，并研究它们与病理的可能关联。
背景及目的：
DNA甲基化是调节基因表达的表观遗传机制，代表了基因型，环境和疾病之间的重要联系。这是一种可逆和可遗传的机制，也许可以为治疗某种疾病提供目标。本项研究旨在评估以前与克罗恩病（CD）相关的特定基因的甲基化变化，并研究它们与病理的可能关联。
方法：
本项研究纳入了103名参与者，将他们分为2个队列（第一个模型队列[n = 31]和第二个验证队列[n = 72]），其中包括了活跃CD（aCD）和非活跃CD（iCD）以及健康参与者（CTR） 。从所有受试者中的外周血中获得DNA，并通过Agena平台进行分析。选择的基因为过氧化氢酶（CAT），α-防御素5（DEFA5），FasR，FasL，肿瘤坏死因子（TNF），TNFRSF1A，TNFRSF1B，PPA2，ABCB1，NOD2，PPARγ。
结果：
研究发现16种CpG在aCD，iCD和CTR中显示出不同的甲基化特征。研究人员选择了差异最大的那些进行验证：DEFA5 CpG_11； CpG_13； CAT CpG_31.32； TNF CpG_4，CpG_12；和ABCB1 CpG_21。结果验证为DEFA5（甲基化增加）和TNF（甲基化损失）的基因，P值<0.001。在这两种情况下，甲基化水平均保持不变，且不会随CD活性而变化（aCD与iCD）。
讨论：
DEFA5和TNF基因的甲基化状态提供了标志性生物标志物，可鉴别CD患者并支持CD发病机制中环境和免疫系统的可能作用。
原始出处：
Moret-Tatay. Et al. Identification of Epigenetic Methylation Signatures With Clinical Value in Crohn's Disease. Clinical Translational Gastroenterology.2019.
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