JAMA Oncol：新型血液检测在症状出现之前发现感染
2020-02-14 小通 生物通
最近，美国圣朱迪儿童研究医院（St. Jude Children's Research Hospital）的研究人员在《JAMA Oncology》杂志上报告称，一种基于测序的血液检测能够在儿科癌症患者出现感染症状之前发现感染。
最近，美国圣朱迪儿童研究医院（St. Jude Children's Research Hospital）的研究人员在《JAMA Oncology》杂志上报告称，一种基于测序的血液检测能够在儿科癌症患者出现感染症状之前发现感染。
在这项研究中，研究人员评估了Karius公司微生物游离DNA测序在检测血液感染上的敏感性和特异性。Karius是一家从斯坦福大学分离出的传染病诊断公司，一直致力于利用血液中的微生物循环DNA来检测感染。
研究人员发现，这种微生物游离DNA测序方法通常可在感染发生前数日检测出血液中的病原体，并且有很好的敏感性和特异性。文章作者之一Josh Wolf表示：“癌症患儿的父母往往希望他们有一个水晶球，能够预测接下来发生什么。这种检测也许就是。”
此次研究共招募了47名儿科癌症患者，他们的平均年龄为10岁，患有复发性或难治性白血病。12名患者经历了19次血液感染，而研究人员保留了其中16次发作出现症状前的血液样本。
血浆微生物游离DNA测序在Karius的CAP/CLIA实验室中开展。它在其中12个样本中发现了感染性病原体，预测敏感性为75%。以15例细菌感染来计，预测敏感性为80%。同时，总体上的诊断敏感性为83%，细菌感染为88%。
研究人员还检测了33个阴性对照样本。27个样本中未检测到细菌或真菌，特异性为82%，且33个样本有30个未发现常见的血液病原体，特异性为91%。
研究人员指出，这种75%的预测敏感性高于其预先定义的50%的有利值。然而，由于假阳性率高，他们报告的82%特异性使得这种方式不适用于筛查。
此外，他们还指出，目前许多检测机构暂时不能在筛查允许的时间范围内给出微生物游离DNA测序的结果。不过他们认为，随着技术的进步，微生物游离DNA测序最终可用来指导癌症患者的早期治疗。
文章作者之一、Karius的高级医学总监Asim Ahmed表示：“Karius检测目前还不是一项筛查检测；还需要进行其他研究，以指导如何在临床应用中使用该检测，来帮助预测和预防免疫功能低下患者的感染。”
原始出处：Kathryn P. Goggin, Veronica Gonzalez-Pena, Yuki Inaba, et al. Evaluation of Plasma Microbial Cell-Free DNA Sequencing to Predict Bloodstream Infection in Pediatric Patients With Relapsed or Refractory Cancer. JAMA Oncol. December 19, 2019.
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顶刊就是顶刊，谢谢梅斯带来这么高水平的研究报道，我们科里同事经常看梅斯，分享梅斯上的信息
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