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Investigative Radiology:结合深度学习和放射组学实现自动且全面的全身MRI骨髓特征评估!

2023-07-18 shaosai MedSci原创 发表于上海

现代全身成像技术,如磁共振成像(MRI)或正电子发射断层扫描,可以评估完整的骨髓(BM),并且根据目前的指南对单克隆浆细胞疾病进行评估。

多发性骨髓瘤(MM)可累及整个骨骼系统,这对于分期、治疗反应评估和并发症评估带来了极大的困难。现代全身成像技术,如磁共振成像(MRI)或正电子发射断层扫描,可以评估完整的骨髓(BM)并且根据目前的指南对单克隆浆细胞疾病进行评估。由于时间限制,放射科医生通常只会报告BM病变的大致数量、少数示范性病变的大小、是否有骨折以及对肿瘤负荷是否增加、稳定或减少的总体印象。

然而,这种方法导致了从wb-MRI的数百万个体素到放射科医生报告的信息的巨大损失这限制了影像学在临床决策和精确肿瘤学研究中的影响力。肿瘤负荷往往异质地分布在全身骨骼上,MM中也有空间基因组异质性的描述。

为了充分捕捉肿瘤疾病中骨髓病变的复杂性,并最大限度地利用成像数据集中的信息,需要一个新的概念来分析骨髓:首先,为每个骨髓空间(BMS)提取大量的特征,收集每个局部发现的信息,其次,将所有局部信息整合到整体的骨髓状态。为了将该系统应用于临床实践或大规模的研究数据集,这样的系统需要自动执行所有步骤。多发性骨髓瘤是一种散发性骨髓受累的典型疾病,大量的影像学特征,如病灶的大小、体积、强度和纹理以及弥漫性浸润。然而,即使在专门的肿瘤报告系统中,如MY-RADS22,报告中也只包括少数这样的高级影像特征。

近日,发表在Investigative Radiology杂志的一项研究通过自动分割BM和随后对30个不同的BM空间(BMS)进行放射组学分析,实现从Wb-MRI自动、全面描述BM的概念。

项回顾性的多中心试验研究使用了来自8个中心的102名MM患者的总共106张wb-MRI图像进行评估。来自1号中心的50个wb-MRI用于训练分割算法(nnU-Nets)和放射组学算法来自8个中心的56张wb-MRI用于独立测试。对来自90个wb-MRI的2700个BMS进行了人工分割,用于分割算法的训练和测试。对于每个BMS,单独计算296个放射组学特征。使用Dice评分来评估自动分割和人工参考分割之间的相似性。 

使用多标签nnU-Net "分割算法对30个BMS进行分割,并对其进行单独标记在来自中心1/中心2/中心3-8的独立测试集中,平均骰子得分达到0.88±0.06/0.87±0.06/0.83±0.11(放射科医生间的差异性,0.88±0.01)。来自多中心、多厂商测试集的子集(3-8中心),成像质量高分割精度高(平均骰子得分,0.87),与1中心的内部测试数据相当。对所有病人计算了由每个病人8880个描述性参数组成的放射组学BM表型,该表型是对30个BMS中的每一个的296个放射组学特征的计算结果。示范性病例显示了MM的典型骨髓模式与各自BMS的放射组学特征之间的相关性。在可信度测试中,基于放射组学BM表型模型的预测大小和体重与患者的实际大小和体重明显相关(分别为P = 0.002和P = 0.003)。 


 
图 在外部测试集中由多标签lnnU-Net进行的全身骨髓自动分割。左侧显示的是冠状T1加权涡轮脊柱选择图像(A,D),中间显示的是由多标签lnnU-Net在该图像上提供的自动分割的2D叠加(B,E)。在右边(C,F)显示了所得到的三维模型,其中有30个单独标记的骨髓空间。上排,外部测试集I(中心2)的41岁男性多发性骨髓瘤患者的示例图像。下行,外部测试集II中新诊断的多发性骨髓瘤的59岁男性患者(中心8)

本项研究实施了一种深度学习算法,在多中心的数据集中,通过对每个BMS的单独标记实现了从Wb-MRI中进行稳健的自动BM分割。与每个BMS的后续放射组学分析相结合,使传播性BM疾病的自动、全面、客观的BM表型成为可能。这一概念允许从全身成像中自动提取全面的、结构化的数据并用于大规模的研究分析,以实现精确的肿瘤学评估。

原文出处:

Markus Wennmann,André Klein,Fabian Bauer,et al.Combining Deep Learning and Radiomics for Automated, Objective, Comprehensive Bone Marrow Characterization From Whole-Body MRI: A Multicentric Feasibility Study.DOI:10.1097/RLI.0000000000000891

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