Bioinformatics:人类流感感染生物学机制研究新进展
2017-03-26 MedSci MedSci原创
近期，在Bioinformatics杂志的一篇文章中提出了一项新的，关于检测人流感感染生物学机制研究的进展。基因集富集分析(GSEAs)被广泛用于基因组的研究，以找出潜在的生物学机制。例如：基因本体论或分子机制。在目前可用的方法中，有以下两点说明：1、通常用于组间比较的回归分析，并不能有效地利用转录组测量的时间序列相关的时间信息；2、在多分子途径中的基因重叠，在假设检验中被多次测量。该作者提出了一
近期，在Bioinformatics杂志的一篇文章中提出了一项新的，关于检测人流感感染生物学机制研究的进展。
基因集富集分析(GSEAs)被广泛用于基因组的研究，以找出潜在的生物学机制。例如：基因本体论或分子机制。
在目前可用的方法中，有以下两点说明：1、通常用于组间比较的回归分析，并不能有效地利用转录组测量的时间序列相关的时间信息；2、在多分子途径中的基因重叠，在假设检验中被多次测量。
该作者提出了一个基于函数型数据分析的GSEA推论框架，使其可以利用基于函数型主成分分析的时间信息，并能通过弹性网络回归的功能扩展对重叠基因的影响进行松解。
其次，基因组的假设检验是Mann-Whitney U检验的延伸，他是基于相关观测值计算得出的加权秩和。
研究者通过模拟数据库，及大规模的人类流感感染后的时间进程基因表达数据库的分析，证明了其采用的方法，能得出更好的受试者工作特征曲线。并且，与其他的方法相比，该研究方法能够识别更多的人类流感感染的免疫反应相关通路。
原始出处：
Zhang Y，Topham DJ，Thakar J，et al.FUNNEL-GSEA： FUNctioNal ELastic-net regression in time-course gene set enrichment analysis.Bioinformatics. 2017 Feb 21. doi： 10.1093/bioinformatics/btx104.
本文系梅斯医学（medsci）原创编译整理，转载需授权！
小提示：本篇资讯需要登录阅读，点击跳转登录
版权声明：
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于梅斯医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章，或“梅斯号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
在此留言
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于梅斯医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章，或“梅斯号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
在此留言
#生物学机制#
55
#Bio#
41
#机制研究#
0
该作者提出了一个基于函数型数据分析的GSEA推论框架，使其可以利用基于函数型主成分分析的时间信息，并能通过弹性网络回归的功能扩展对重叠基因的影响进行松解。
76
#生物学#
54
谢谢分享，涨知识了
106
谢谢分享，学习了
79
这个能出资料详细讲一下吗？
83
学习新知识谢谢
90
很好的补充了自己的不足
43