Immunity：科学家们开发了对病毒感染机制成像的新方法

全世界有超过3500万的病毒感染者，每年有近200万的新病例，HIV仍然是一种主要的全球流行病。虽然抗逆转录病毒疗法（ART）可以控制感染，但休眠的HIV感染的免疫细胞持续存在于整个身体的某些组织中，如果抗逆转录病毒疗法被中断，就会重新开始行动。这种潜伏的病毒库是发展治愈HIV的一个主要挑战。

为了更好地了解HIV持续存在的机制和病理学，包括BIDMC病毒学和疫苗研究中心首席研究员Sizun Jiang博士在内的研究人员开发了一种新方法，使该团队能够描述感染了SIV（一种相关病毒）的组织内的病毒库和免疫反应，与未感染的对照组织进行比较。这样做揭示了感染和未感染组织之间的差异，使科学家们能够为SIV感染抑制免疫反应的机制提出一个模型。

"目前研究病毒组织库的方法往往需要将细胞从其原生组织环境中取出，"主要作者Jiang说，他在斯坦福大学时就开始了这项工作，并在BIDMC完成。"我们的技术使我们能够在原地表征蛋白质分子，这对于实现病毒感染和其他方面的研究是最重要的。

结合其他成像技术，该团队使用了PANINI-蛋白质和核酸原位成像技术，该技术利用抗体来量化组织区间内的DNA、RNA和蛋白质水平，以测量健康或SIV感染的非人类灵长类动物的存档淋巴组织中的30多个组织特征。该技术帮助揭示了组织微环境中的11个不同区域，或细胞邻域。当研究人员在健康组织和感染组织之间比较这些邻域时，这些差异证实了众所周知的逆转录病毒感染的标志，并使科学家们能够开发一个机器学习模型来预测病毒的激活。

Jiang说："基本问题仍然存在，未来的原位工作对于提高我们对病毒感染和其他问题的理解至关重要。"我们预计PANINI，加上其他广泛采用的成像策略，代表着在推进更好地指导治疗干预策略所需的洞察力方面迈出了一大步。"

该研究发表在《免疫》上。

原始出处：

Sizun Jiang et al， Combined protein and nucleic acid imaging reveals virus-dependent B cell and macrophage immunosuppression of tissue microenvironments， Immunity (2022). DOI： 10.1016/j.immuni.2022.03.020.