Epigenetics Chromatin：巨噬细胞活化期间转录增强子的全基因组谱分析
2017-11-03 MedSci MedSci原创
巨噬细胞是组织稳态和宿主防御所必需的哨兵细胞。由于其可塑性，巨噬细胞可获得一系列反应的微环境刺激的功能表型，其中M（IFN-γ）和M（IL-4和IL-13）因其抗亲炎和抗炎作用则被熟知。增强子已成为调控基因表达激活的关键DNA元件。通过对基因表达和表观遗传数据的分析，研究人员确定了骨髓源性巨噬细胞的大规模转录增强子，其时间动力学和靶蛋白编码基因。研究观察到靶基因表达的增加，伴随着相关增强子数量的增
巨噬细胞是组织稳态和宿主防御所必需的哨兵细胞。由于其可塑性，巨噬细胞可获得一系列反应的微环境刺激的功能表型，其中M（IFN-γ）和M（IL-4和IL-13）因其抗亲炎和抗炎作用则被熟知。增强子已成为调控基因表达激活的关键DNA元件。
通过对基因表达和表观遗传数据的分析，研究人员确定了骨髓源性巨噬细胞的大规模转录增强子，其时间动力学和靶蛋白编码基因。研究观察到靶基因表达的增加，伴随着相关增强子数量的增加，且发现与许多增强子相关的基因表现出向巨噬细胞特异性生物过程更强的富集转变。研究人员推断促进基因对M（IFN-γ）和M（IL-4/IL-13）巨噬细胞活化的转录反应的增强子，并显示调节相关性的刺激特异性。最后，研究人员发现增强子区域富集炎症相关转录因子的结合位点，提示刺激反应和增强子转录控制之间存在关联。
总之，该研究为全基因组增强子介导的巨噬细胞基因转录调控提供了新的见解，包括那些参与巨噬细胞活化的基因，并提供了一个详细的全基因组转录本目录。
原始出处：
Elena Denisenko, Reto Guler, et al., Genome-wide profiling of transcribed enhancers during macrophage activation. Epigenetics Chromatin. 2017; 10: 50. Published online 2017 Oct 23. doi: 10.1186/s13072-017-0158-9
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