Am J Pathol:基因异常预测前列腺癌复发
2012-05-10 Beyond 生物谷
良性或恶性组织中的基因异常预测前列腺癌复发,一项有关更高效、准确技术的研究论文发表在American Journal of Pathology杂志上。 2012年5月7日,主动监测50岁以上的血清前列腺特异性抗原(PSA)的水平已大大提高了前列腺癌的早期检测,但诊断后临床结果的预测仍然是一个重大的挑战。匹兹堡大学医学院的研究人员发现在前列腺癌以及相邻的肿瘤良性前列腺组织和前列腺癌患者血液中一个基
良性或恶性组织中的基因异常预测前列腺癌复发,一项有关更高效、准确技术的研究论文发表在American Journal of Pathology杂志上。
2012年5月7日,主动监测50岁以上的血清前列腺特异性抗原(PSA)的水平已大大提高了前列腺癌的早期检测,但诊断后临床结果的预测仍然是一个重大的挑战。匹兹堡大学医学院的研究人员发现在前列腺癌以及相邻的肿瘤良性前列腺组织和前列腺癌患者血液中一个基因异常拷贝数变异(CNV),可以预测病人是否会复发以及复发的性质:侵略性或惰性。研究报告发表在美国病理学杂志。
基因拷贝数变异是指DNA片段大小范围从kb到Mb的亚微观突变,是一可能具有致病性、良性或未知临床意义的基因组改变。美国匹兹堡大学医学院病理科分子和细胞病理学分部副教授Jian-Hua Luo博士说: 我们的分析表明,CNV的发生于癌症和非癌症组织中,这些组织的CNV可预测前列腺癌的进展。预测前列腺癌复发或手术后的PSA水平的提高率的预测模型,是由肿瘤或良性前列腺癌旁组织癌样本中生成而来的。
为了检测到异常,科学家进行了全面的基因组分析,从接受前列腺癌根治术的男性中获得238例样本:104前列腺肿瘤样本,85个血液样本,前列腺患者癌和49例良性前列腺组织样本。在不到四个月的时间里,三分之一的样本显示PSA水平快速上升,三分之一的样本PSA水平上升缓慢,三分之一的样本显示手术后无复发超过5年。
运用肿瘤基因特异性的CNV,该模型正确预测的73%为复发病例。从邻近的前列腺肿瘤的组织CNV模型正确预测67%的复发病例。从血液中位数大小的CNV来看,基因模型正确预测81%的复发的情况下,69%的PSA倍增时间短。
Luo医生指出,有几个潜在的CNV测试具有临床应用前景。 对于诊断患有前列腺癌的病人,对血液或正常组织做CNV分析,将消除需要额外的侵入性程序以决定治疗模式。对于一个已经有前列腺癌根治术的病人,对肿瘤新生血管或血液样本分析可能有助于决定是否额外的治疗是必要的,以防止复发。
doi:10.1016/j.ajpath.2011.12.021
PMC:
PMID:
Gene Deletions and Amplifications in Human Hepatocellular Carcinomas:
Michael A. Nalesnik, George Tse, Ying Ding, Guo-Sheng Xiang, Zhong-liang Zheng, YanPing Yu,et al.
Tissues from 98 human hepatocellular carcinomas (HCCs) obtained from hepatic resections were subjected to somatic copy number variation (CNV) analysis. Most of these HCCs were discovered in livers resected for orthotopic transplantation, although in a few cases, the tumors themselves were the reason for the hepatectomies. Genomic analysis revealed deletions and amplifications in several genes, and clustering analysis based on CNV revealed five clusters. The LSP1 gene had the most cases with CNV (46 deletions and 5 amplifications). High frequencies of CNV were also seen in PTPRD (21/98), GNB1L (18/98), KIAA1217 (18/98), RP1-1777G6.2 (17/98), ETS1 (11/98), RSU1 (10/98), TBC1D22A (10/98), BAHCC1 (9/98), MAML2 (9/98), RAB1B (9/98), and YIF1A (9/98). The existing literature regarding hepatocytes or other cell types has connected many of these genes to regulation of cytoskeletal architecture, signaling cascades related to growth regulation, and transcription factors directly interacting with nuclear signaling complexes. Correlations with existing literature indicate that genomic lesions associated with HCC at the level of resolution of CNV occur on many genes associated directly or indirectly with signaling pathways operating in liver regeneration and hepatocyte growth regulation.
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