Blood：儿童B细胞前体淋巴瘤的基因和转录特征

B细胞前体淋巴瘤（BCP-LBL）是一种罕见的儿童恶性肿瘤，与B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）在形态上相似，但两者在分子层面的特征尚未完全揭示。过去的研究主要集中在BCP-ALL，而BCP-LBL的分子特征研究有限，特别是其基因突变和分子亚型的差异还不明确。因此，迫切需要通过基因组学分析来揭示BCP-LBL的独特分子特征，从而为更有效的个性化治疗提供依据。近年来，随着全外显子组测序（WES）和RNA测序等技术的发展，研究者有了更多机会分析儿童肿瘤的分子特征。

近日，Kroeze 等研究组在 Blood 发表了题为 Mutational and transcriptional landscape of pediatric B-cell precursor lymphoblastic lymphoma 的论文。该研究通过全外显子组测序（WES）和RNA测序，对97例BCP-LBL患者的基因特征进行了全面分析，探索了BCP-LBL的基因突变谱及其与BCP-ALL的分子差异。结果发现，BCP-LBL与BCP-ALL在基因层面有相似性，然而BCP-LBL中表观遗传调控基因的突变频率更高，并发现了多种新型基因融合。

研究纳入了97名儿童BCP-LBL患者，样本来源于不同的组织类型，包括新鲜冷冻样本和福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本。通过全外显子组测序（WES）和RNA测序（RNA-seq），研究对这些患者的基因突变和表达进行了全面的分析。

图. 研究设计和患者队列图解，包括年龄组、活检部位以及执行的下一代测序分析

研究发现，BCP-LBL和BCP-ALL在很多关键基因上表现出相似的突变模式，如细胞周期调控、RAS信号通路和B细胞发育相关的基因。然而，表观遗传调控基因（如KMT2D、EP300、ARID1A）的突变在BCP-LBL中更为常见，这一现象在BCP-ALL中则较为少见。这些基因的突变可能与药物耐药性和治疗反应有关。

图. BCP-LBL与BCP-ALL中基因异常频率比较

研究还发现了一些新型的基因融合，例如与PAX5、TCF3相关的融合。这些新融合不仅为疾病的机制研究提供了新线索，还为未来可能的靶向治疗提出了潜在的方向。

图. BCP-LBL中染色体增益和丢失的概览

在染色体分析中，研究发现BCP-LBL患者中非整倍体现象较为常见，特别是与染色体21的扩增相关。这些染色体的异常可能在疾病的进展中起到重要作用。

总之，通过详细的基因组和转录组分析，本研究揭示了小儿BCP-LBL的基因突变和分子特征。研究表明，BCP-LBL与BCP-ALL在基因层面存在显著的相似性，但同时也表现出独特的分子特征，特别是表观遗传调控基因的突变更为常见。这些发现为BCP-LBL的诊断和个性化治疗提供了重要的线索，尤其在针对表观遗传基因的治疗策略开发方面具有潜在的临床应用价值。这为个性化治疗方案提供了新的视角，特别是表观遗传调控基因的高频突变可能为未来的靶向治疗提供新方向。