Cell Rep：科学家对肠癌中蛋白质的研究为肠癌治疗提供线索
2017-08-30 佚名 medicalxpress
科学家们首次完成了对肠癌细胞中许多蛋白质的详细研究。来自WellcomeTrustSangerInstitute的科学家调查了蛋白质在预测常见突变如何影响癌细胞中蛋白质的作用以及这些蛋白质在预测癌症对治疗反应方面的重要作用。
科学家们首次完成了对肠癌细胞中许多蛋白质的详细研究。来自WellcomeTrustSangerInstitute的科学家调查了蛋白质在预测常见突变如何影响癌细胞中蛋白质的作用以及这些蛋白质在预测癌症对治疗反应方面的重要作用。
8月29日结果在Cell Report中发表，使科学家们更好地了解肠癌后的细胞过程，并且可以使研究人员能够预测哪些药物可以有效治疗不同的肠癌患者。
每天有110人被诊断患有肠癌。每年有大约4100例新病例，是英国第四大癌症。
为了了解癌症的生物学基础，科学家传统上研究了所有的癌症基因-癌症中的基因组和所有RNA-转录组。然而，研究中的盲点一直是研究所有的蛋白质-蛋白质组-它是蛋白质，它们是细胞机械的基础。
在新研究中，科学家对肠癌中的蛋白质进行了深入细致的研究，以研究蛋白质在预测不同药物对癌症的作用方面发挥的作用。研究人员分析了50种肠癌细胞系中的9,000种蛋白质。
JyotiChoudhary博士说：“这项研究是结肠直肠癌细胞系的第一次详细表征，重要的是将蛋白质组学纳入癌症研究中，因为蛋白质是已知蛋白质组合和功能的独特信息，过去的基因组和转录组研究已被证明是癌症研究中的一个盲点-但现在包括蛋白质组，我们有全貌。”
该团队能够构建促进肠癌的蛋白质协调网络。研究人员使用CRISPR-Cas9来破坏或敲除编码关键蛋白质的单一基因，并观察其网络中蛋白质的影响。
威康信托桑格研究所的第一作者TheodorosRoumeliotis博士说：“我们发现，沉默一个基因会对网络的其余部分产生影响，减少了其他蛋白质的数量，就像一个涟漪效应一样，我们已经确定了蛋白质网络可以用于肠癌药物，我们只能通过研究蛋白质组来发现。”
在研究中，该小组在50个肠癌细胞系中测试了265种现有的抗癌药物。以前已经将基因组和转录组的细节用于预测哪些药物在特定癌症病例中起作用，但是某些药物的活性无法预测。
通过研究蛋白质组，该团队可以预测未被基因组学或转录组学解释的药物反应。
UltanMcDermott博士说：“这项研究对肠癌患者有希望，它证实这种常见的癌症实际上由五种不同的亚型组成，可能需要不同的药物治疗，令人惊讶的是，蛋白质可能比我们以前认为的更容易预测药物敏感性，未来我们可能需要测试患者的基因组，转录组和蛋白质组，以充分预测其对癌症药物的反应，并更有效地分层患者进行临床试验。一切都适合个性化医学。”
原始出处：
TI Roumeliotis, SP Williams, E Goncalves, et.al. Genomic determinants of protein abundance variation in colorectal cancer cells. Cell Reports (2017)
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它证实这种常见的癌症实际上由五种不同的亚型组成.可能需要不同的药物治疗.令人惊讶的是.蛋白质可能比我们以前认为的更容易预测药物敏感性.未来我们可能需要测试患者的基因组.转录组和蛋白质组.以充分预测其对癌症药物的反应.并更有效地分层患者进行临床试验.一切都适合个性化医学.
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