Gut：郑州大学张明智/李兆明等发现肠道菌群作为自然杀伤/T细胞淋巴瘤的无创性诊断和预后生物标志物

“菌群-肠道-淋巴瘤轴”代表了菌群介导的淋巴瘤发生和干预机会的一个有趣的途径，但肠道菌群在自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL）中的意义仍然是谜。

2022年11月8日，郑州大学张明智、李兆明及华中科技大学陈卫华共同通讯在Gut（IF=32）在线发表题为“Gut microbiota as non- invasive diagnostic and prognostic biomarkers for natural killer/T- cell lymphoma”的研究论文，该研究表明肠道菌群可以作为自然杀伤/T细胞淋巴瘤的无创性诊断和预后生物标志物。该研究招募了一个发现队列，包括30名治疗组- naïve患者和20名健康对照(HCs)，以及一个验证队列，分别包括12名患者和13名HCs。作者对他们的粪便样本进行“鸟枪法”宏基因组测序，使用mOTUs2 V .2.5,分析他们的肠道宏基因组，并使用SIAMCAT实现的LASSO算法训练一个具有所有物种级别分类特征的患者分层分类器。该研究的分类器在发现队列上的接收者工作特征曲线(AUROC)下的面积达到了0.868的准确性，在验证队列上实现了0.910 AUROC的准确度。为了增加模型训练的样本量，作者使用两个队列的所有样本为NKTCL重新训练LASSO分类器，并取得了0.813的精度。AUROC交叉验证，这有力地支持肠道菌群作为NKTCL诊断生物标志物的作用。

为了检验NKTCL肠道菌群衍生特征的特异性，作者将全样本NKTCL分类器应用于29个公共肠道菌群队列。作者观察到hc的总假阳性率(FPR)为3.1%，但在几个队列的患者中FPR较高，特别是胰腺癌、克罗恩病和肝病。这些结果意味着这些疾病和NKTCL之间的生物标志物有显著重叠，这是通过LEfSe分析证实的。

重要的是，这些生物标志物在大多数队列中持续富集/减少，包括患者中口腔衍生的Veillonella 和 Streptococcus的富集，以及HCs中已知的有益物种，如Faecalibacterium prausnitzii、Eubacterium rectale and Bifidobacte-rium adolescentis。这些结果表明，作者的分类器可以准确地区分NKTCL患者和HCs；然而，由于有与其他疾病共享的生物标记物，因此，将所选临床指标与菌群生物标记物结合将有助于建立独特的诊断模型。

相关数据结果（图源自Gut  ）

发现队列中NKTCL患者的生存数据可用。值得注意的是，许多已确定的菌群生物标志物，特别是那些由多种疾病共享的菌群生物标志物，可以显著预测患者的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)，包括副蛇形链球菌、timmonensis和异型细孔菌(在线补充图1A-D)。最后，作者建立了Streptococcus parasanguinis, Romboutsia timonensis 和Veillonella atypica指数(SRI)作为两个物种的相对丰度比，得到了比其他个体种和组合最好的预测能力。也就是说，SRI得分较高的NKTCL患者的OS和PFS明显低于SRI得分较低的患者。此外，作者观察到高SRI评分与NKTCL的多个不良预后因素之间存在显著相关性。

总之，该研究结果支持肠道菌群作为NKTCL的有效辅助诊断工具。此外，基于共享生物标志物的SRI评分可能在多种疾病的预后中具有广泛的效用，值得进一步研究。

原文链接：

https://gut.bmj.com/content/early/2022/11/08/gutjnl-2022-328256?rss=1