Cancer Cell：基于6004名中国人全基因组分析肺癌的罕见易感突变分析

研究亮点：

• 对 2,984 名非小细胞肺癌患者和 3,020 名对照者进行全基因组测序
• 基于高质量单倍型参考确定的五个常见和低频基因座
• DNA修复基因中罕见的功能缺失变异增加了NSCLC的风险
• BRCA2 启动子的罕见变异导致 NSCLC 风险增加

我们进行了迄今为止最大规模的非小细胞肺癌(NSCLC)全基因组测序(WGS)研究，研究对象包括6004名中国个体，以及23,049名通过SNP阵列进行基因分型的个体。

我们提出了迄今为止对 6,004 名中国血统的个体进行的最大的非小细胞肺癌 (NSCLC) 全基因组测序 (WGS) 研究，以及通过 SNP 阵列进行基因分型的 23,049 名个体。我们构建了一个用于插补的高质量单倍型参考面板，并确定了 20 个常见和低频基因座（次等位基因频率 [MAF] ≥ 0.5%），包括五个以前从未报道过的基因座。

对于罕见的功能丧失 (LoF) 变异 (MAF < 0.5%)，我们确定了 BRCA2 和 18 个其他癌症易感基因，这些基因影响 5.29% 的 NSCLC 个体，并且 98.91% (183 个中的 181 个) LoF 变异之前没有与非小细胞肺癌风险联系起来。 BRCA2 的启动子变体对 NSCLC 风险也有显著影响，其患病率与 BRCA2 LoF 变体相当。

这些关联在一项包括 4,410 人的独立病例对照研究和一项包括 23,826 人的前瞻性队列研究中得到验证。我们的研究结果不仅为未来基于阵列的关联研究提供了高质量的参考面板，而且描绘了NSCLC罕见致病变异的全貌。

原始出处：

Wang C, Dai J, Qin N, Fan J, Ma H, Chen C et al. Analyses of rare predisposing variants of lung cancer in 6,004 whole genomes in Chinese. Cancer Cell 2022.