JAMA Netw Open:多中心队列研究揭示,RNA+DNA-NGS联合检测可提高晚期NSCLC患者SV检出率
临床上应同时使用RNA-NGS和DNA-NGS检测,以便最大限度地检出SV;RNA-NGS也应在晚期NSCLC患者的治疗中常规使用。
测序中国 - NSCLC,SV检出率 - 2024-11-12
Genome Biol:中山大学李淼新团队发表基于三代测序的结构变异(SV)检测流程综合评估结果
该项研究是迄今为止基于TGS数据的基因组SV流程最广泛的评估。分析表明,相比于比对工具的选择,调用器的选择对SV检测流程的准确性影响更大。
测序中国 - 三代测序,结构变异 - 2024-08-08
NBT:叶凯团队开发基于“序列-图像”转换的差异比较算法SVision-pro,实现高精确性SV检测及分型
叶凯教授团队开发了SVision-pro,这是一种基于神经网络的实例分割框架,能够直观地表示基因组到基因组水平的测序差异,并在无需任何推断模型的条件下比较地发现基因组之间的SV。
测序中国 - 测序,SVision-pro,SV检测 - 2024-04-16
Nat Commun发表迄今最大的亚洲多祖先SV图谱,揭示亚洲人群的基因组变异模式
新加坡团队利用亚洲血统新加坡人 WGS 数据开展大规模 SV 研究,分析不同祖先群体 SV 图谱、特性、影响等,创建亚洲最大 SV 数据库,填补亚洲人群基因组变异理解空白,有重要价值。
测序中国 - 基因组,结构变异 - 2024-11-16
Cell Reports:西湖大学团队及合作者绘制中国健康老龄化人群的肠道微生物SV图谱
西湖大学等团队绘制中国健康人群肠道微生物 SV 图谱,分析其概况、衰老动态变化,探究与健康衰老关联,为研究微生物 SV 对健康影响提供见解。
测序中国 - 肠道微生物,健康衰老 - 2024-12-09
Genome Biol:席瑞斌团队发表肿瘤新抗原预测算法NeoSV,泛癌分析揭示SV为肿瘤新抗原重要来源
该研究证明了基因突变相关的新抗原负荷,能够比肿瘤新抗原负荷更好地描述肿瘤与免疫的相互作用,并可能改善患者对免疫治疗的选择。
测序中国 - 泛癌分析,NeoSV - 2023-08-11
WGS数据分析全面表征不同儿童脑肿瘤类型体细胞SV特征
研究团队分析了PBTA中744个儿童脑肿瘤样本的全基因组序列,共检测到13,199个高置信度的体细胞SV;进一步分解简单和复杂SV特征以推断其突变机制,发现不同肿瘤类型的SV特征存在巨大的异质性。
测序中国 - 脑癌,儿童脑肿瘤,结构变异,全基因组序列 - 2023-11-19
MRD检测和ctDNA检测的应用
治疗后ctDNA可以由阳性转阴性,意味着手术或辅助治疗方案可以清除MRD,从而改变其疾病进展和生存。而ctDNA继续呈阳性或者是由阴转阳,可能预示着存在MRD,这可能是一个提示改变治疗方案的信号。
医世象 - 肺癌,MRD检测,ctDNA检测 - 2022-08-07
血液检测可检测8种肿瘤类型
一项新的癌症血液测试可检测八种常见疾病,这为普遍的癌症血液检测提供了可能。这种癌症检测方法从16个基因和8个蛋白质生物标志物中检测循环肿瘤DNA (ctDNA),然后利用基于机器的学习来分析这些数据。研究人员对1,005名非转移性临床检测到的卵巢,肝脏,胃,胰腺,食管,结直肠癌,肺癌或乳腺癌患者进行了检测。在8种癌症中,癌症检测的中值为70%。对5种癌症类型(卵巢、肝脏、胃、胰腺和食道)的检测,灵
MedSci原创 - 癌症血液检测 - 2018-01-19
多重定量检测方法检测多寄生现象
由于蠕虫感染的患病率和传播直接与感染的流行性和强度相关,这尤其需要使用改良的检测技术,如聚合酶链式反应(PCR)方法学,针对上述目的评估感染的强度。
检验视界网 - 多重定量检测,多寄生现象,寄生虫检测 - 2016-05-26
智能手机成瘾量表(SAS-SV)
2022-02-18
心脏疾病患者运动恐惧量表(Tampa Scale for kinesiophobia Heart,TSK-SV Heart)
心血管,康复医学 - 2021-04-19
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