Front Immunol：使用生物信息学分析鉴定肺纤维化和肺动脉高压之间的共享基因特征

研究背景：

肺纤维化（PF）和肺动脉高压（PH）具有共同的病理生理特征，如肺实质和血管壁的显著重塑。目前临床治疗中没有有效的特定药物用于这两种疾病，导致预后恶化和更高的死亡率。本研究旨在通过生物信息学的方法筛选PF和PH的共同关键基因和免疫特征，以寻找新的共同治疗靶点。

研究方法及研究结果：

我们下载了基因表达数据库中的表达谱。采用加权基因共表达网络分析来识别与PF和PH相关的共表达模块。我们使用ClueGO软件对PF和PH中的共同基因进行富集和分析，并获得了蛋白质相互作用（PPI）网络。然后，在另一个PF和PH的队列中筛选出差异基因，并进行了交叉分析。最后，对交叉基因进行了RT-PCR验证和免疫浸润分析。结果中确定了PF和PH之间具有最高相关性的正相关模块，并发现淋巴细胞激活是PF和PH病理生理学的共同特征。获得了8个共同的特征基因（ACTR2、COL5A2、COL6A3、CYSLTR1、IGF1、RSPO3、SCARNA17和SEL1L）。

免疫浸润显示，与对照组相比，PF和PH中静止的CD4记忆T细胞上调。结合在ImmPort数据库中交叉特征基因的结果和RT-PCR，获得了重要的基因IGF1。敲除IGF1能够显著减少由缺氧、血小板衍生生长因子-BB（PDGF-BB）和转化生长因子-β1（TGF-β1）诱导的肺微血管内皮细胞、肺平滑肌细胞和成纤维细胞的增殖和抗凋亡抵抗。我们的研究确定了PF和PH的共同生物标志物，并为未来的PF和PH潜在治疗靶点提供了新的候选基因。

研究结论：

该研究提出淋巴细胞激活可能是影响PF和PH病因的关键途径，并确定了IGF1作为重要的与免疫相关的共同基因。这些数据发现为未来的研究和治疗PF和PH的新潜在治疗靶点提供了基础。

参考文献：

Zhao H, Wang L, Yan Y, Zhao QH, He J, Jiang R, Luo CJ, Qiu HL, Miao YQ, Gong SG, Yuan P, Wu WH. Identification of the shared gene signatures between pulmonary fibrosis and pulmonary hypertension using bioinformatics analysis. Front Immunol. 2023 Sep 4;14:1197752. doi: 10.3389/fimmu.2023.1197752. PMID: 37731513; PMCID: PMC10507338.