HLA:两个不同供应商的Luminex单抗原珠测定的平均荧光强度值协调和截止预测建模方法
2023-05-04 Jenny Ou MedSci原创 发表于上海
在使用当前模型发现两个供应商在特定于珠子的反应性分配中具有94%的准确性,建议使用具有自HLA校正和特定位点分析的非线性双曲线建模方法协调两个供应商之间的MFI值。
由于其高特异性和敏感性,Luminex单抗原珠(SAB)检测是确定HLA抗体特异性的绝佳工具。目前,SAB检测由两家供应商商业化,One Lambda(OL)和Lifecodes-Immucor(LC)。两家供应商都提供平均荧光强度(MFI)值作为抗体与SAB结合的读数。
尽管是半定量读数,但MFI值经常被用作临床决策的截止值。然而,两家供应商之间的制造工艺(例如,抗原密度和涂在珠上的完整性)和SAB测定的测试方案的差异可能导致MFI值的差异。因此,使用随意选择的MFI值作为截止值,对I类和II类使用单一截止值,或者根据仅与一家供应商合作的经验使用通用截止值,可能会导致对SAB结果的误解。
到目前为止,两家供应商的SAB结果已经在一些研究中进行了比较,其中要么探讨了导致两家供应商之间最佳协议的MFI范围,要么使用两个供应商的单一截止值来分配阳性结果。
Reed等人提出,两个供应商之间最佳协议的最佳MFI截止值在1000到1500 MFI之间。Clerkin等人表明,当阳性抗体分配的MFI截止值为4000而不是1000时,两个供应商之间的协议增加了。除此之外,研究者们在这些研究中使用线性回归模型来评估两个供应商之间MFI值的相关性。
值得注意的是,目前还没有研究提供一种策略来模拟两个供应商的MFI值之间的关系,从而使MFI从一个供应商转换到另一个供应商。许多中心同时使用两个供应商的套件或从一个切换到另一个,这就需要协调两个供应商的MFI值。
2023年5月2日发表在HLA上的文章,研究者们的目标是生成一种方法,用于在HLA抗体结果的大数据集中协调两个Luminex SAB供应商的MFI值之间的截止值。为此,研究者们首先开发了一个非线性双曲线模型,以更好地理解来自两个不同供应商的MFI值在给定数据集中的相互关系,然后使用该模型建立数据驱动的、可比较的、特定于供应商的截止点,完全独立于用户使用一个或另一个供应商的体验。
非线性模型最优拟合数据:(A)背景校正/基线MFI上常见HLA I类珠的线性和非线性回归模型(B) raw MFI
线性模型用红色表示,非线性双曲线模型用绿色表示
使用OL和LC SAB试剂盒对47例经edta处理的血清HLA抗体数据进行分析。MFI比较常见HLAⅰ类珠84例和ⅱ类珠63例。在探索集(n = 24)中,通过基因座特异性最高自MFI减法校正的原始MFI非线性双曲线模型产生了最高的相关性(I类 r2=0.946, II类 r2= 0.898)。
在独立验证集(n = 12)中验证模型的性能(I类 r2=0.952, II类 r2=0.911)。此外,在移植后血清样本的独立队列(n = 11)中,使用当前模型规定的供应商特异性MFI截止值,我们发现两家供应商在头部特异性反应性分配方面的准确率为94%。
通过实验结果,研究者们建议使用非线性双曲线建模方法与自我HLA校正和位点特异性分析来协调特定研究数据集中两个供应商之间的MFI值,并且由于两种检测方法之间存在相当大的差异,不建议对单个患者样本使用MFI转换。
根据文献检索发现,本文是首篇提供非线性建模方法的研究,能够在两个供应商之间转换MFI值,并建立用户独立、特定于数据集的MFI截止。目前的模型将有助于为两个不同的工具包建立可比的MFI截止值,至少在研究大型数据集的人口层面上。但是,研究者们强烈建议对单个患者样本进行抗体模式分析,以获得准确的HLA抗体分配,但应该记住,根据特异性,两种检测的变化排除了单个患者从一个供应商到另一个供应商的MFI转换。
原始出处
A modeling approach for mean fluorescence intensity value harmonization and cutoff prediction for luminex single antigen bead assays of two different vendors. HLA. 2023; 1- 13. doi:10.1111/tan.15082 , , , , , .
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