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Scientific Reports:**软件可预测癌症转移

2014-11-26 佚名 生物谷

西部大学研究人员在实验室中开发出尖端的基因突变分析软件,来解释肿瘤基因组的突变,其可以帮助确定哪些乳腺癌更可能扩散到身体的其他部位,哪些肿瘤不会。 他们的结果发表在Scientific Reports杂志上。主要作者Stephanie Dorman表示:我们正在利用我们实验室的一个独特的软件方案,着眼于一种称为剪接突变类型的突变。 她说,以前遗传研究发现在445肿瘤中,这些剪接突变数目为4

西部大学研究人员在实验室中开发出尖端的基因突变分析软件,来解释肿瘤基因组的突变,其可以帮助确定哪些乳腺癌更可能扩散到身体的其他部位,哪些肿瘤不会。

他们的结果发表在Scientific Reports杂志上。主要作者Stephanie Dorman表示:我们正在利用我们实验室的一个独特的软件方案,着眼于一种称为剪接突变类型的突变。

她说,以前遗传研究发现在445肿瘤中,这些剪接突变数目为429,而新开发的分析软件能找到5000多个。使用这个软件和癌症基因组图谱的人类肿瘤组织样本基因数据,研究团队精确定位,神经细胞粘附分子(NCAM)和其他相关的基因NCAM生物突变在已经淋巴结转移的肿瘤中出现较高频率。NCAM通常存在于神经细胞中,也高度表达的在乳腺组织中,并参与细胞间通讯。

我们相信,在某些患者中,这些生物学途径的突变可能会导致一些肿瘤的特性,使它能够迁移到身体的其他部位。研究人员希望这些研究结果将帮助肿瘤科医生和临床实验室在肿瘤活组织切片检查中寻找这些基因突变,以预测哪些妇女更有可能发生肿瘤转移。

原始出处

Dorman SN1, Viner C2, Rogan PK3.Splicing mutation analysis reveals previously unrecognized pathways in lymph node-invasive breast cancer.Sci Rep. 2014 Nov 14

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