Clin Chem：细胞外囊泡长片段RNA测序显示人类血液中含有丰富的mRNA、circRNA和lncRNA，可作为癌症诊断的潜在生物标志物
2019-08-03 不详 MedSci原创
细胞外囊泡<span lang="EN-US" style="font-size:12.0pt;mso-bidi-font-size:14.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"; mso-fareast-font-family:宋体;mso-bidi-font-family:"Times New Roman
细胞外囊泡(EVs)含有丰富的不同种类的RNA，因此可能具有特殊的功能和临床应用。然而，目前对于人类血液中细胞外囊泡长RNA (exLR)的结构和特征尚不明确。
本研究提出一种优化的人血浆exLR测序(exLR-seq)方法。样本队列包括159名健康个体、150名癌症患者(5种癌症类型)和43名其他疾病患者。应用生物信息学方法分析了exLRs的分布和特点。采用支持向量机算法构建诊断分类器，通过ROC分析评价诊断效率。
研究显示，在1-2 mL血浆中，每一份exLR-seq样品中均能检测到10000多个exLRs，包括mRNA、circRNA和lncRNA。进一步观察到，血液ev中含有大量完整的mRNA片段和大量的拼接连接，同时也含有丰富的circRNA。更为有趣的是，血液exLRs反映了它们的组织起源和不同免疫细胞类型的相对比例。此外，exLR图谱可以区分癌症患者和健康个体。进一步研究证明8个exLRs可以作为肝癌(HCC)诊断的生物标志物，且在测试中具有较高的诊断效率[曲线下面积(area under
the curve, AUC) = 0.9527;95% CI, 0.9170-0.9883]，验证队列为(AUC =
0.9825;95% CI, 0.9606-1)，检验队列为(AUC =
0.9627;95%可信区间,0.9263 -
-0.9991)。
综上所述，本研究发现人血浆中存在丰富的exLRs，并发现了多种可能用于癌症诊断的特异性标志物。
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