BMC Cardiovasc Disord：通过生物信息学分析鉴定慢性血栓栓塞性肺动脉高压中铁死亡相关的潜在生物标志物和免疫细胞特征

研究背景：

慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）是一种罕见的逐渐进展的肺血管疾病，通常是急性肺栓塞的后果。CTEPH的特征是持续的血栓栓塞性肺动脉梗阻和可变的小血管病变。近年来的研究表明，每百万人口中有3到30人患上CTEPH。CTEPH的早期症状通常不明显。患有晚期CTEPH的患者死亡率较高，最近5年的存活率低于40%。CTEPH的发病机制被认为由多种因素引起，包括高凝血性、纤溶异常、炎症、肺微血管增生。CTEPH在早期阶段很难诊断，仍然缺乏预测其严重性和临床结局的生物标志物。因此，探索更有价值的遗传生物标志物，以了解CTEPH的潜在病因和治疗靶点，至关重要。一种新的铁介导的细胞死亡类型是铁死亡（Ferroptosis），其特点是致命铁离子和脂质过氧化的积累，导致线粒体萎缩和线粒体膜密度增加。目前，缺乏与CTEPH发病过程相关的铁死亡相关生物标志物（FRBs）。

研究方法：

使用GEO2R获取CTEPH的差异表达基因（DEGs）。从FerrDb数据库获取与铁死亡相关的基因。铁死亡与DEGs的交集结果产生FRBs。在Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery（DAVID）数据库中进行基因本体（GO）和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）分析。使用最小绝对值收缩和选择算子（LASSO）和支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）机器学习分析CTEPH的最佳潜在生物标志物。从基因表达数据库GSE188938验证了四个核心基因。使用CIBERSORT分析了免疫浸润。使用SPSS软件分析了FRBs与浸润相关免疫细胞之间的Spearman秩相关，p < 0.05被认为是统计学上显著的。

研究结果：

在这项研究中，调查了与CTEPH中的铁死亡相关的潜在遗传生物标志物，并探讨了它们在免疫浸润中的作用。总共，我们通过GEOquery软件包确定了17个差异表达的与铁死亡相关的基因。使用Lasso和SVM-RFE机器学习方法筛选出的关键FRBs包括ARRDC3、HMOX1、BRD4和YWHAE。通过GSE188938验证，只有基因ARRDC3的上调显示出统计差异。此外，使用CIBERSORT算法的免疫浸润分析显示，CTEPH样本中嗜酸性粒细胞和中性粒细胞的浸润少于对照组。相关性分析显示，ARRDC3与T细胞滤泡助手呈正相关（r = 0.554，p = 0.017），与中性粒细胞呈负相关（r = -0.47，p = 0.049）。

研究结论：

总之，ARRDC3上调与不同的免疫细胞浸润参与了CTEPH的发展。ARRDC3可能是CTEPH治疗的潜在铁死亡相关生物标志物。这项研究为CTEPH的发病机制提供了新的见解。

原始出处：

Lin J, Lin S, Zhang Y, Liu W. Identification of Ferroptosis-related potential biomarkers and immunocyte characteristics in Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension via bioinformatics analysis. BMC Cardiovasc Disord. 2023 Oct 11;23(1):504. doi: 10.1186/s12872-023-03511-5. PMID: 37821869.