Front Immunol:基因组学发现——炎症性肠病与类风湿关节炎在遗传层面具有某些一致性
2024-06-22 潘华 MedSci原创 发表于上海
IBD和RA在遗传构造上的共享,并为这两种疾病高共病率背后的遗传架构和机制提供了新见解。
炎症性肠病(IBD)和类风湿关节炎(RA)的共病率较高,但其高共病率的原因尚不清楚。这两种疾病在基因构成上的相似性可能是导致共病的一个因素。了解IBD和RA之间的基因关联和潜在的因果关系对于深入理解这两种疾病的共病机制具有重要意义。因此,本研究旨在通过全基因组关联研究(GWAS)数据,探索IBD和RA之间的遗传相关性,识别共享的遗传风险位点,并分析这两种疾病可能的共同组织起源。
本研究基于IBD和RA的GWAS数据,首先通过连锁不平衡得分回归(LDSC)分析进行总体遗传关联评估。接下来,使用总结统计数据中的遗传率估计(HESS)进行局部相关性分析,并通过双样本Mendelian随机化(MR)分析探讨两种疾病之间的因果关系。通过条件/联合假发现率(cond/conjFDR)方法分析遗传重叠,使用具有特定基因表达的LDSC(LDSC-SEG)分析确定两种疾病相关的组织。最后,进行了GWAS多特征分析(MTAG)。
研究结果
本研究通过全基因组关联研究(GWAS)数据分析,发现炎症性肠病(IBD)和类风湿关节炎(RA)在遗传层面存在显著的关联性。通过连锁不平衡得分回归(LDSC)分析和遗传率估计(HESS)方法,我们揭示了IBD和RA在整体和局部水平上的遗传相关性,显示了两者共享的遗传风险构造。
我们使用双样本Mendelian随机化(MR)技术分析了IBD对RA的潜在因果影响,结果表明IBD可能会增加RA的风险。此外,利用条件/联合假发现率(cond/conjFDR)方法,我们成功鉴定了20个IBD和RA共有的遗传风险位点,这些位点表明两种疾病在分子机制上可能存在交叉影响的基因区域。功能注释分析进一步探究了这些共享位点的生物学功能,揭示了它们主要涉及蛋白激酶结合、细胞因子刺激反应等关键生物过程,以及与EBV感染和JAK-STAT信号通路有关的通路。这些通路在调控免疫响应和炎症过程中发挥重要作用,为理解IBD和RA的共病机制提供了新的线索。
RA和IBD(包括CD和UC)的遗传相关性
本研究证实了IBD和RA在遗传构造上的共享,并为这两种疾病高共病率背后的遗传架构和机制提供了新见解。研究结果不仅增进了我们对IBD和RA共病遗传基础的理解,还可能帮助未来策略性地改进这两种疾病的治疗方法。
原始出处:Inflammatory bowel disease and rheumatoid arthritis share a common genetic structure. Front. Immunol., 13 June 2024. Volume 15 - 2024 | https://doi.org/10.3389/fimmu.2024.1359857
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