Nat Microbiol：上海交通大学何平/苏州大学周哲敏揭示了碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌血清型的流行和动态

需要了解循环碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的流行病学知识，以制定有效战略应对这一公共卫生威胁。

2024年2月29日，上海交通大学何平及苏州大学周哲敏共同通讯在Nature Microbiology 在线发表题为“Carbapenem-resistant Klebsiella  pneumoniae capsular types, antibiotic resistance and virulence factors in China: a longitudinal, multi-centre study”的研究论文，该研究进行了一项纵向、多中心研究，揭示了中国耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌荚膜类型、抗生素耐药性和毒力因素。该研究对2016年至2020年间从中国40家医院的患者中分离出的1017株CRKP进行了纵向分析。毒力基因和胶囊分型显示，CRKP胶囊型KL64扩增(59.5%)，KL47患病率下降。

高致病性CRKP的患病率从2016年的28.2%上升到2020年的45.7%。系统发育和时空分析表明，北京和上海是KL47和KL64菌株在中国不同地域流行的传播枢纽。在分离株中还检测到中频胶囊或O抗原丢失。非荚膜型CRKP更易被吞噬，在小鼠感染过程中被减弱，但血清耐药性和生物膜形成增加。这些发现CRKP血清型的流行和动态，揭示了监测血清型变化对未来开发针对CRKP感染的免疫策略的重要性。

耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)由于其多重耐药性质和引起高死亡率感染的能力，已成为一个主要的公共卫生威胁。根据2023年中国抗微生物药物监测网络(CHINET)的数据，肺炎克雷伯菌已成为中国临床第二大分离细菌，对美罗培南的耐药率从2005年的2.9%稳步上升至2023年的30.0%。耐药流行率的增加反过来限制了治疗选择，并增加了对控制CRKP感染的新策略的需求。

针对表面多糖抗原的疫苗，如荚膜多糖(CPS, K抗原)或脂多糖(LPS，O抗原)，已被提出作为抗多药耐药病原体的一种有希望的替代抗菌剂。疫苗和单克隆抗体在实验动物模型中显示出对肺炎克雷伯菌的保护作用，但尚未超出人体临床试验的范围。此外，肺炎克雷伯菌含有至少79种荚膜类型(K型)，它们在遗传和表型上都不同，这对实现广泛的疫苗覆盖构成了重大挑战。因此，有必要对最流行和临床相关的血清型(生物体表面抗原类型，如K或O抗原)进行最新的流行病学了解，以有效地为疫苗开发战略提供信息和指导。

2016-2020年中国26个省市CRKP分离株荚膜基因型及抗菌谱分析（图源自Nature Microbiology ）

肺炎克雷伯菌的流行率因国家和宿主而异。近年来，一些研究报道了肺炎克雷伯菌感染在不同国家的流行情况，包括耐药性、毒力和荚膜基因型的分布和流行情况。然而，对其在中国的血清流行病学知之甚少，主要是由于用于血清学分型的商业抗体的可用性有限，以及基因分型无法检测由基因突变或多糖合成相关基因破坏引起的表型变异。CRKP相关感染在中国的广泛发生和扩大，需要对不同地区分离菌株的种群结构、耐药机制和毒力进化进行系统分析。

该研究在中国进行了一项全国性的、纵向的、回顾性的CRKP流行病学调查。该研究提供了该国CRKP菌株中K型分布和纵向进化、抗微生物药物耐药性(AMR)和毒力因子谱的综合数据。特别是，在各种感染样本中发现了相当比例的荚膜或O-抗原缺陷菌株，并通过实验研究了这些荚膜缺陷菌株获得生存优势的潜在基础。这些血清型患病率的发现为制定控制CRKP感染的有效策略提供了初步见解。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41564-024-01612-1