MEJM：临床上首次证实单克隆抗体治疗会导致新冠病毒发生压力突变

严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的刺突蛋白（spike）突变可导致免疫功能低下且感染时间较长的患者逃避中和抗体。 这种病毒逃避被假设为导致全球变异的出现，在缺乏有效免疫反应的情况下，单克隆抗体治疗等选择性压力可能导致免疫学上重要突变的出现。

为了了解驱动宿主内 SARS-CoV-2 进化的选择压力，我们在从五名 B 细胞缺陷患者获得的便利样本中检查了这种进化与内源性免疫反应和外源性抗体治疗之间的关系。 所有患者在首次阳性检测后 42 至 302 天（第0)）。该研究得到了埃默里大学机构审查委员会的批准。从捐赠全血样本进行研究的患者（患者 2、4 和 5）获得知情同意。

患者 1 未接受抗体治疗，并且在第 37 天对中和抗体呈阴性。患者 2 和 3 分别在第 4 天和第 8 天接受了单克隆抗体 bamlanivimab 治疗。他们的血清在第 33 天（在患者 2 中）和第 55 天（在患者 3 中）有效地中和了参考假病毒（Wuhan-Hu-1），并分别在第 77 天和第 83 天保持中和抗体滴度升高（图 1A）。患者 4 在第 0 天和第 104 天接受恢复期血浆，在第 82 天和第 101 天检测不到中和抗体。患者 5 在第 200 天接受恢复期血浆，在第 204 天获得低中和抗体滴度。与刺突蛋白结合的 IgG 滴度反映了血清中和作用滴度。除了一名患者（患者 2）外，所有患者最终都康复了。患者 2、4 和 5 提供了用于免疫表型分析的外周血样本。与健康对照组和年龄匹配的住院患者相比，所有这三名患者的淋巴细胞计数均较低，CD19+ B 细胞频率低至检测不到（患者 2 为 0.19%，患者 4 为 0.01%，患者 5 为 0.01%）患有新型冠状病毒病 (Covid-19) 的患者（图 S3）。患者 3 具有临床上低水平的 T 和 B 细胞。因此，患者 2、3 和 5 中针对参考 SARS-CoV-2 的抗体反应可能是由于外源性治疗。在患者 4 和 5 中可检测到 SARS-CoV-2 特异性效应 T 细胞反应，CD8+ T 细胞分泌抗病毒干扰素-γ 和肿瘤坏死因子，但仅在患者 2 的背景水平上可检测到（图 1B 和 1C和图 S4、S5 和 S6）。

图：五名免疫功能低下患者的中和抗体滴度、效应 T 细胞反应和尖峰突变。

SARS-CoV-2 测序揭示了患者 2 和 3 的刺突蛋白进化（图 1D）；这两名接受过 bamlanivimab 治疗的患者都缺乏 T 细胞和 B 细胞。在刺突受体结合结构域 (RBD) 和 N 末端结构域 (NTD) 中发现了一致水平的突变和样本内单核苷酸变异，这些区域与免疫逃逸相关。相比之下，在未接受抗体的患者 1 或接受恢复期血浆并对 SARS-CoV-2 具有完整 T 细胞反应的患者 4 和 5 中没有发现 RBD 或 NTD 突变。

为了评估从患者 1、2 和 3 获得的病毒是否已被自体血清中和，我们构建了表达变异spike的传染性假病毒。尽管来自患者 2 和 3 的血清中和了参考假病毒，但来自患者 1、2 和 3 的血清并未中和具有变异spike的假病毒。因此，患者 2 和 3 中的spike突变赋予了对 bamlanivimab 的中和抗性。

我们的研究结果发现选择压力的潜在重要性，例如使用单克隆抗体——结合缺乏有效的内源性免疫反应——在促进 SARS-CoV-2 逃逸突变的出现方面的潜在重要性。这些发现强调需要更好地了解不同疗法对免疫功能低下患者的影响。我们的结果也证实了先前研究的结果，在这些研究中发现 B 细胞缺陷的患者会引发效应 T 细胞，这一结果可能表明 T 细胞在控制感染中发挥重要作用。

原始出处：

Scherer EM, Babiker A, Adelman MW, Allman B, Key A, Kleinhenz JM, Langsjoen RM, Nguyen PV, Onyechi I, Sherman JD, Simon TW, Soloff H, Tarabay J, Varkey J, Webster AS, Weiskopf D, Weissman DB, Xu Y, Waggoner JJ, Koelle K, Rouphael N, Pouch SM, Piantadosi A.SARS-CoV-2 Evolution and Immune Escape in Immunocompromised Patients.N Engl J Med. 2022 Jun 23;386(25):2436-2438. doi: 10.1056/NEJMc2202861