stroke:全基因组测序分析支持维生素D代谢在缺血性中风中的作用
2023-02-15 MedSci原创 MedSci原创 发表于上海
现有的观察证据表明维生素D水平与脑血管疾病之间存在关联
缺血性中风(IS)是一种高度遗传的性状,全基因组关联研究已经确定了这种情况的几个常见的易感性风险位点。然而,关于罕见遗传变异对IS的贡献的数据有限。
近期,来自美国耶鲁大学的学者利用152058名英国生物银行参与者的全外显子组测序数据进行了一项全外显子组研究,其中包括1777例IS。对罕见变异进行了单变异分析,对功能丧失和缺失性罕见变异进行了基于基因的分析。随后通过以下方法验证了这些结果:(1)利用MEGASTROKE--一项包括67162名IS病例和454450名对照的IS全基因组关联研究的汇总统计数据进行基于基因的测试;(2)利用1706名IS幸存者的个人水平数据进行基于基因的测试,包括142名复发的IS病例,这些幸存者参加了VISP试验(维生素干预预防中风);以及(3)利用42310名有磁共振成像数据的英国生物库参与者的汇总水平数据进行与脑血管病有关的神经影像表型的基于基因的测试。
结果显示,在单变体关联分析中,所评估的变体都没有在全基因组的显著性水平上与IS相关(P<5×10-8)。在基于基因的分析中,重点是功能丧失和缺失性变异,CYP2R1的罕见遗传变异与IS风险显著相关(P=2.6×10-6),超过16074次测试的Bonferroni校正阈值(P<3.1×10-6)。验证分析表明,CYP2R1与MEGASTROKE的IS风险有关(基于基因的测试,P=0.003),与VISP试验中的IS复发有关(基于基因的测试,P=0.001),与UK Biobank神经影像研究中的神经影像特征(白质高信号、平均扩散率和分数各向异性)有关(所有基于基因的测试,P<0.05)。
综上,由于CYP2R1在维生素D代谢中起着重要作用,而且现有的观察证据表明维生素D水平与脑血管疾病之间存在关联,本研究的结果支持这一途径在IS的发生中发挥作用。
参考文献:
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