ReactomeGSA:高效的单细胞通路分析工具
Pathway analyses是组学实验分析的关键方法。然而,整合来自不同组学技术和不同物种的数据仍然需要大量的生物信息学知识。在单细胞数据科学中,Pathway analyses也是基因表达数据链
简书 - 单细胞 - 2021-02-06
CELL:人类脑部恶性肿瘤单细胞分析
组织驻留和入侵的免疫细胞在TME内的异质性允许我们明确区分胶质瘤和脑转移瘤(BrM)。胶质瘤TME主要是以组织驻留、反应性小胶质细胞为主,而组织侵入性白细胞主要积累在脑转移瘤中。
MedSci原创 - 胶质瘤,免疫细胞,脑肿瘤,脑转移瘤 - 2020-05-30
Nature:单细胞分析技术的革命性进展
本文介绍人类细胞图谱(HCA)项目,阐述单细胞技术挑战及突破,如 PopV、SCimilarity 等工具,还有多数据整合、细胞间相互作用、虚拟疾病模型等方面工具及应用,展望 HCA 未来。
生物探索 - 单细胞技术,人类细胞图谱 - 2024-11-22
单细胞分析支持癌症干细胞在脑肿瘤生长中的作用
在单细胞水平上分析脑肿瘤基因组学的研究发现,癌症干细胞促进了少突神经胶质瘤的生长,少突神经胶质瘤是一种生长缓慢但不可治愈的脑癌。他们的文章提前在“自然界”杂志上在线出版。由麻省总医院(MGH)和麻省理工学院及哈佛大学研究所的调查员领导的小组,首次识别癌症干细胞及其在人类脑肿瘤样本中的分化后代。MarioSuvà博士说:“我们的工作强烈支持癌症干细胞是这些肿瘤生长的主要来源,因此,应该被认为
生物谷 - 癌症干细胞 - 2016-11-04
Cardiovasc Res:肺动脉高压内皮细胞的单细胞测序分析
内皮细胞功能障碍推动了肺动脉高压 (PAH) 的发生和发病机制。 我们旨在以单细胞分辨率表征 PAH 中的内皮细胞 (EC) 动力学。
MedSci原创 - 肺动脉高压,单细胞转录组 - 2021-09-29
【直播预告】单细胞测序文献中常用的高级分析
6月11日19:30,生信技能树创始人曾健明为大家直播【单细胞测序文献中常用的高级分析】
MedSci原创 - 单细胞测序,单细胞分析 - 2021-06-08
PNAS:庄小威发表新方法助力单细胞RNA分析
系统性分析单细胞的RNA丰度和空间定位,有助于我们理解细胞和发育生物学的许多方面。单分子荧光原位杂交(smFISH)是在单细胞中研究RNA拷贝数和空间
生物通 - 庄小威,单细胞RNA分析 - 2016-11-25
Nat Commun发表人类单细胞长读长全基因组分析新方法,可为单细胞遗传变异提供新见解
长读长测序可提高单细胞遗传变异检测的性能,特别是检测单倍型、复杂结构变异和串联重复序列(TR);并证明从头重建部分人类T细胞基因组是可行的。
测序中国 - 长读长全基因组,单细胞遗传变异 - 2023-09-13
NEUROPATHOLOGY AND APPLIED NEUROBIOLOGY:高通量单细胞RNA表达分析方法识别人类周细胞标记
根据单细胞RNA-seq分析、免疫菌块和免疫组织化学研究的综合结果,SLC6A12抗体非常适合标记人类FFPE脑切片中的周细胞。
MedSci原创 - 周细胞,高通量单细胞RNA表达分析 - 2023-10-21
NATURE:阿尔茨海默病的单细胞转录组学分析
阿尔茨海默病(AD)是一种普遍存在的神经退行性疾病,至今为止,我们对于其分子和细胞复杂性仍然知之甚少。
MedSci原创 - 阿尔兹海默 - 2019-05-04
Nature Methods:GPT-4在单细胞分析中的突破:高效的细胞类型识别
研究人员展示了GPT-4在利用标记基因(marker gene)信息进行细胞类型标注方面的准确性和效率。
生物探索 - GPT-4,单细胞RNA测序 - 2024-03-29
Clin Cancer Res:前列腺癌液体活检样本的单细胞分析
研究表明,循环肿瘤细胞(CTCs)具有临床相关性,但是由于它们出现的频率低,限制了人们对它的研究。研究发现,清血法具有良好的耐受性,并且能够分离大量的CTCs细胞;从7.5mls患者外周血中获得的CTC细胞平均产量为167个,而每次
MedSci原创 - 前列腺癌,清血法,循环肿瘤细胞 - 2018-08-17
Nature:新型单细胞分析技术揭示干细胞中的复杂突变
近日,来自波士顿儿童医院等处的研究人员利用新型的单细胞基因分析技术揭示了多能干细胞的多种遗传突变,相关研究刊登于国际著名杂志Nature上,为后期开发治疗疾病的新型再生性疗法提供了一定的帮助和希望。研究者James Collins表示,在单一细胞之间干细胞群体会包含许多差异,而这在干细胞工程学领域开发预测性的方法却会带来一点问题,如今研究者发现,他们此前考虑过的细胞间的问题性差异或许实际上
生物谷 - 干细胞,单细胞,突变 - 2014-12-31
NIH悬赏10万美元,寻求单细胞分析解决方案
细胞是生物体结构和生命活动的基本单元。在单个细胞水平上进行研究,可以获得反映细胞生理状态和过程的更准确、更全面的信息,还可以使人们能更好地了解细胞群体中某些特殊的细胞功能,更深入地认识细胞个体差异、细胞间相互作用和信息传递以及神经递质、药物或毒物刺激的生理影响等更深层次的信息因此,单细胞分析技术的研究与发展具有重要意义,已成为分析科学中的一个新兴的前沿领域。NIH悬赏10万美元,寻求单细胞分
科学网博客 - 单细胞,分析科学 - 2014-08-18
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