Nucleic Acids Research:李磊团队构建单细胞遗传调控平台解析疾病位点的细胞特异性机制
该研究整合了包括eQTLGen联盟,DICE项目和OneK1K在内的304个sc-eQTL数据集,涵盖了57种细胞类型和95种细胞状态,除了涉及外周血外,还囊括了脑和肺组织。
测序中国 - 全基因组关联分析,单细胞遗传调控平台,细胞特异性机制 - 2023-10-09
打造免疫学细胞研究”全链条”,推动“流式平台”与“单细胞平台”高效对接
2020年8月8日,由全球领先的医疗技术公司BD(中国)主办,以“智联·碧合”为主题的第二届单细胞免疫学国际峰会在沪隆重召开。
MedSci - 2020-08-08
Science:新型单细胞扩增技术有助避免遗传病
中美研究人员在新一期美国《科学》杂志上报告说,他们研制出一种新型单细胞全基因组扩增技术,在此基础上不仅有望避免许多遗传性疾病遗传给后代,从基因组角度更深入地认识癌症也将成为可能。
新华网 - 遗传病,基因组 - 2017-04-16
Nat Commun:2天制备1万个单细胞WGBS文库!首个基于液滴的高通量单细胞DNA甲基化测序平台发表
新开发的基于液滴的高通量单细胞亚硫酸氢盐测序平台(Drop-BS)。Drop-BS利用液滴微流体技术实现了超高通量,并可在2天内制备多达10000个单细胞的亚硫酸氢盐测序文库。
测序中国 - DNA甲基化,WGBS文库 - 2023-08-24
Nat Commun发表人类单细胞长读长全基因组分析新方法,可为单细胞遗传变异提供新见解
长读长测序可提高单细胞遗传变异检测的性能,特别是检测单倍型、复杂结构变异和串联重复序列(TR);并证明从头重建部分人类T细胞基因组是可行的。
测序中国 - 长读长全基因组,单细胞遗传变异 - 2023-09-13
Blood:单细胞分析揭示调控红细胞分化的血红素-GATA1反馈回路
中心点:在早期红细胞生成过程中,血红素迅速上调核糖体蛋白基因,以确保有足够的核糖体可用于球蛋白翻译。随后,血红素下调GATA1、GATA1靶基因和有丝分裂梭形基因,使红细胞分化得以正常终止。摘要:红细胞发生是一个复杂的、动态的、受严格调控的过程,产生所有的成熟红细胞。为了解该过程,Raymond T.Doty等人绘制了单细胞水平的野生型、红细胞生成素处理的和Flvcr1敲除的小鼠的造血祖细胞的发
MedSci原创 - 血红素,红细胞,GATA1,核糖体 - 2019-01-02
迟洪波团队最新Nature:利用体内单细胞CRISPR筛选,绘制肿瘤T细胞命运调控网络
本研究表明,促进Tpex细胞从静止状态中退出和丰富增殖Tex细胞状态是抗肿瘤感染的关键模式,并为整合细胞命运调节和可编程功能决定因素提供一个系统框架。
BioMed科技 - CRISPR,癌症免疫治疗,肿瘤T细胞,CTLs - 2023-11-18
Nat Genet:神经母细胞瘤的表观遗传调控研究
研究采用ChIP–seq的方法,分析了间质细胞和肾上腺素细胞的等位基因对,分别发现了每种细胞类型中的超强增强子图谱和与超强增强子相关的转录因子网络。间质细胞转录因子PRRX1的表达可以对超强增强子和肾上腺素细胞mRNA图谱重编程,使其达到间质细胞的状态。间充质细胞在体外具有更高的化学抗性,并在治疗后和复发的肿瘤中富集。
MedSci原创 - 神经母细胞瘤,表观遗传 - 2017-06-30
Blood:单细胞测序揭示骨髓肿瘤突变上位性的遗传分子基础
RNA剪接因子突变上位性逃脱发生在特定的突变等位基因,并保留一个野生型等位基因;RNA结合和/或剪接中的等位基因特异性差异解释了剪接因子突变的排他性与共存性。
MedSci原创 - SF3B1,血液恶性肿瘤,SRSF2,剪接因子,上位性(epistasis) - 2020-07-17
Mission Bio推出Tapestri平台对单细胞DNA和蛋白质同时测序,以识别准确的癌症靶标
Mission Bio推出了"第一个也是唯一一个"平台,能够在单个细胞中对DNA和蛋白质进行测序,从而为精密医学识别更准确的癌症靶标。
MedSci原创 - MISSION,Bio,Tapestri平台,单细胞测序,识别癌症靶标 - 2019-11-07
ATAC-seq技术再升级:单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术
基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能,可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段(通常80-300 bp),这些短片段被当作开放染色质的信号。
iNature - ATAC-seq技术再升级,单分子测序,单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13
Genome Biol:李薛鑫团队及合作者创建人类单细胞多组学图谱及网络平台SCA
该图谱资源和数据库查询旨在为各种组学研究提供一站式、全面且高效的资源,帮助人们更深入地理解不同人类组织的复杂性。
测序中国 - SCA,单细胞多组学图谱 - 2024-05-10
Stem Cells:低氧介导的脑肿瘤细胞干性的表观遗传调控
多能调节通路的活化是实体肿瘤进展中的重要过程,目前研究表明缺氧的微环境可以增强一些细胞的干细胞特征。癌症干细胞(CSCs)/肿瘤起始细胞(TICs)可以增加侵袭、转移和耐药性。此前有研究报道了神经胶质瘤的全球低甲基化和位点特异性异常甲基化以及其他表观遗传修饰,它们是胶质瘤进展期间基因组不稳定性的重要参与因素。近期,一项发表在杂志Stem cells上的研究证明了缺氧介导的表观遗传修饰在调节神经胶质
MedSci原创 - 低氧,肿瘤,干细胞 - 2017-04-09
Cancer Cell:首次揭示T细胞淋巴瘤的表观遗传调控机制
近日,中国科学技术大学生命科学学院医学中心及中科院天然免疫和慢性疾病重点实验室教授瞿昆课题组联合美国斯坦福大学Howard Chang实验室,首次揭示了T细胞淋巴瘤(CTCL)的表观遗传调控机制。
中国科学技术大学 - T细胞淋巴瘤,表观遗传,调控机制 - 2017-06-28
Nat Commun:单细胞多组学揭示 ENL 突变通过重新布线调控环境扰乱肾脏发育轨迹
本研究为理解表观遗传调节因子突变如何影响肾脏发育和肿瘤生成提供了新的见解。同时,我们的研究还发现了针对这种突变的小分子药物,为治疗相关的肾脏发育异常和肿瘤生成提供了新的希望。
MedSci原创 - 肾脏发育,ENL 突变 - 2024-07-18
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