NAR：哈工大/腾讯AI实验室合作构建迄今最大规模的单细胞蛋白质组数据库SPDB

哈尔滨工业大学研究团队联合腾讯人工智能实验室团队构建了一个全面的单细胞蛋白质组学数据库SPDB。

测序中国 - 癌症研究，单细胞蛋白质组数据库，SPDB - 2023-12-01

circRNADb：首个汇总编码蛋白环状RNA的数据库

10月11日，Nature出版集团子刊Scientific Reports在线发表了南京医科大学Li Yan团队的一项重要环状RNA研究成果，介绍开发了首个汇总可编码蛋白的环状RNA的数据库：circRNADb（数据库网址：http://reprod.njmu.edu.cn/circrnadb）文中作者通过汇总整理，共收集了32914条人类外显子环状RNA记

circRNA 吉赛生物 - 环状RNA，环状RNA的数据库 - 2016-10-15

Genome Medicine：基于人血浆蛋白质组与基因组数据，鉴定新型CRC蛋白质标志物及药物靶点

研究团队对4,853种血浆蛋白与CRC风险之间的因果关联进行了全面研究；采用单细胞类型表达分析来检测结肠肿瘤组织中富集的细胞类型，并进行成药性评估，以探索其作为CRC治疗靶点的潜力。

测序中国 - 结直肠癌，CRC蛋白质标志物 - 2023-10-30

Clin Chem：欧洲生物变异研究(EuBIVAS): 15个经常测量的蛋白质的生物变异数据

欧洲生物变异研究(EuBIVAS)的建立是为了提供严格确定的生物变异数据(BV)。

MedSci原创 - 生物变异数据 - 2019-10-19

ARD: 干燥综合征患者血液和组织中自身反应性 B 细胞库的蛋白质组学分析

干燥综合征患者的ANA和RF库显示组织受限性的、抗原依赖性和不同的亲和力成熟。RF克隆的亲和力成熟在RF克隆衍生的淋巴瘤形成过程中和在被利妥昔单抗暂时破坏后自身反应库的再生过程中进一步偏离。

MedSci原创 - 蛋白质组学，干燥综合征，类风湿因子，抗Ro52抗体，抗La/SSB抗体，抗Ro60抗体，自身反应性B细胞 - 2022-03-19

​Nature Cancer：蛋白质组学数据再分析揭示泛素降解系统在肿瘤发生中关键作用

由泛素介导的蛋白降解系统（ubiquitin-mediated proteolysis system，UPS）是调节蛋白稳态的关键过程，其紊乱可导致易发包括肿瘤在内的多种疾病。

BioArt - 肿瘤，蛋白质组学，泛素，关键作用，降解系统 - 2019-12-03

Nat Biotech：中国学者建立国际首个一站式蛋白质组数据分析云系统Firmiana

5月9日，国家蛋白质科学中心（北京）秦钧教授课题组、华东师范大学石铁流教授课题组、复旦大学丁琛教授课题组联合在Nature Biotechnology杂志上发表了题为“Firmiana: towardsa one-stop proteomic cloud platform for data processing and analysis”的文章，建立国际首个一站式蛋白质组数据分析云系统Firmi

BioArt - 蛋白质组数据 - 2017-05-12

Nat Commun：超30万病例的遗传数据分析发现40种蛋白质与9种常见癌症风险相关

研究团队利用337,822例癌症病例的数据，采用顺式蛋白质孟德尔随机化和共定位研究了2074种循环蛋白质和9种常见癌症（膀胱癌、乳腺癌、肺癌、卵巢癌等）的风险。

测序中国 - 癌症，循环蛋白质 - 2024-05-24

Nat Commun：基于12种癌症类型的多组学数据分析，揭示体细胞结构变异对癌症蛋白质组的影响

研究团队将基于MS的蛋白质组学数据与跨不同癌症类型的WGS、多组学数据相结合，以确定体细胞SV断点模式对附近基因蛋白表达的影响。

测序中国 - 癌症蛋白质组，多组学数据分析 - 2023-10-06

Diabetologia：寻找糖尿病的因果途径:一项使用蛋白质组学和基因分型数据的横断面研究

本研究调查了预先选择循环水平的蛋白质是否与结果“糖尿病”相关，以及这些关联是否有因果关系。

MedSci原创 - 糖尿病，因果途径 - 2019-12-24

Nat Methods：新型工具改变科学家对蛋白质的传统认知

近日，一篇发表在国际杂志Nature Methods上的研究论文中，来自Garvan医学研究学院的研究人员表示他们如今已经可以使用公共的网络资源来简化收集3D蛋白质结构的流程，研究者表示，一种名为Aquaria的强大工具或在日后可以帮助改变他们对蛋白质的传统观点。Aquaria是基于蛋白质数据库而建立的，其包含有大约10万种蛋白质结构，蛋白质数据库是一个让众多研究人员非常神往的资源数据库，

生物谷 - 蛋白质，新型工具 - 2015-02-02

古老陶罐内藏惊人病毒

《考古科学杂志》 - 考古，陶器，病毒 - 2016-12-17

AlphaFold最新版——开启数字生物学时代来临! 预测几乎所有分子结构，带来药物研发新范式

大约五年前，DeepMind推出了AlphaFold，一个可以准确预测人体内许多蛋白质结构的人工智能系统，震惊全世界。后来很快又推出AlphaFold 2，进一步提高性能。2022年7月28日，Dee

MedSci原创 - 人工智能，DeepMind，AlphaFold2，AlphaFold，AlphaFold 3 - 2023-11-03

更新再更新 人类基因总数的确定对我们的影响真那么大吗？

自2001年人类基因组计划的最终草案公布以来，蛋白质编码基因的数目先是被确定在2~2.5万个，此后，这一数目先后又被一些研究机构分别修改至1.9万个和超过2.1万个。

生物探索 - 基因 - 2018-09-03