Nature:检测黑素细胞基因组,有望预测黑色素瘤风险
皮肤黑色素瘤是由黑色素细胞(皮肤中产生色素的细胞)引起的皮肤癌,光照是形成黑色素瘤的主要诱变因素。对黑色素瘤肿瘤组织的测序发现,体细胞突变与之密切相关,因此早期诊断意义重大。
生物探索 - 黑色素瘤,黑素细胞基因组,预测风险 - 2020-10-22
Nat Commun:乳头状肾细胞癌的基因组和表观基因组进化史
肿瘤内异质性和肿瘤的进化在透明细胞肾细胞肿瘤(ccRCC)中已经有了很详细的描述,但是在肾脏癌症其他亚型中很少研究。
MedSci原创 - 肾细胞癌,遗传变异,亚型 - 2020-07-06
Science:新型单细胞基因组线性扩增法
谢晓亮教授在4月14日的Science上发表文章报道了实验室的最新研究:一种新型的单细胞基因组线性扩增的方法——转座插入(LIANTI,Linear Amplification with Transposon
生物探索 - 单细胞扩增 - 2017-04-17
PLoS Genet:癌细胞可以简化其基因组
核糖体DNA在拷贝数方面是人类基因组中最可变的区域之一。核糖体DNA对于细胞功能起着重要的作用,但是我们对于其拷贝数,稳定性,在哺乳动物中序列的调控机制几乎一无所知。
MedSci原创 - 癌症 - 2017-06-25
Nature:肿瘤细胞维持基因组稳定之谜破解
与正常细胞相比,癌细胞的分裂速度相当快,其基因组“质量”却相当稳定——它们是怎么做到的?丹麦哥本哈根大学Hickson教授团队与浙江大学呼吸疾病研究所沈华浩教授团队通过合作,发现肿瘤细胞在有丝分裂期存在DNA复制行为,这是肿瘤细胞维持基因组稳定性的关键。共同第一作者、浙大医学院教授应颂敏说,正常细胞的分裂遵循经典的细胞分裂周期理论,在S
MedSci原创 - 肿瘤,基因组 - 2015-12-09
CLIN CHEM:羊水胎儿基因组的全基因组测序和分析
羊膜穿刺术是一种常见的手术,其主要目的是从胎儿收集细胞对异常染色体、染色体拷贝数的改变、少量单基因至多基因缺陷进行测试,。在这里,研究人员展示了从羊水样品的细胞或游离DNA(cfDNA)对胎儿进行精确全基因组分析的可行性。使用Complete Genomics nanoarray平台,对从31个羊膜组织中分离出的cfDNA和DNA进行测序,基因组覆盖率为50×。在一部分样品中,从分离自细胞
MedSci原创 - 羊水,胎儿,基因组 - 2018-04-04
Blood:全基因组测序揭示CAR-19 T细胞治疗淋巴瘤失败的潜在复杂基因组特征
肿瘤固有基因组变异是CAR-19 T细胞疗法对大B细胞淋巴瘤疗效和耐药性的复杂相互作用因素的关键
MedSci原创 - 淋巴瘤,基因组,抗CD19 CAR T细胞疗法 - 2022-08-18
MALBAC单细胞全基因组测序详细解析
单细胞全基因组测序一直是生物学家梦想得到的结果。但是其中必须解决的矛盾:1. 线性扩增。如果用全基因组PCR扩增,因为PCR的扩增偏向性(bias),再加上PCR过程中较小的偏向性通过指数放大,其结果就会是严重的覆盖不均一,导致在许多地方只有很低的覆盖、甚至没有覆盖。全基因组覆盖。常规的建库方法,因为补平、加A、接头连接效率的问题,
陈巍学基因 - 单细胞测序,全基因组 - 2014-04-06
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释.近年来,基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟,实现了对蛋白质组的高覆盖,使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶,GSNOR,NO,炎症因子 - 2014-01-03
Nature:HeLa细胞基因组出乎意料地稳定
HeLa癌细胞系(生物医学研究中使用时间最长、同时也应当是使用最普遍的人细胞系)的首次基因组定性,显示了一个对“点突变”和版本数改变来说都惊人地稳定的基因组。
Nature - HeLa - 2013-09-06
Nat Commun:飞蝗全基因组序列被破译 暂为最大动物基因组
来自中国科学院动物研究所康乐院士领衔的团队、深圳华大基因研究院等单位的科研人员成功破译了迄今为止最大的动物基因组——飞蝗全基因组序列图谱,为揭示蝗灾暴发机制,开发可持续性治理策略及新的控制方法提供了宝贵的遗传资源
MedSci原创 - 基因组,飞蝗 - 2014-01-19
Cell:单细胞全基因组高精彩度测序技术
日前,《细胞》(Cell)杂志上分别报道了来自中国学者的两项最新研究成果。复旦大学的徐彦辉等人首次破解 TET2 -DNA复合物的晶体结构;而来自北京大学的乔杰、汤富酬和谢晓亮等人则发布了突破性单细胞基因组检测技术。
生物360 - Cell,单细胞,全基因组,测序 - 2013-12-25
Nature:成功实现造血干细胞靶向基因组编辑
日前,来自意大利 San Raffaele 科学研究所的研究人员在《自然》(Nature)杂志上称,他们在人类造血干细胞(HSC)突破性地实现了靶向基因组编辑。基因治疗为一些因基因缺陷引起的遗传性疾病提供了良好的治疗效果。然而传统的方法是采用一种遗传工程载体将突变基因的一个功能拷贝传送到病变细胞添 加到基因组中。
MedSci原创 - 基因编辑,干细胞,基因组编辑 - 2014-06-09
Cell:癌症基因组沉思录
癌症基因组沉思录近日,哈佛麻省Broad研究院的著名遗传学家Eric S.Lander教授与另外一位学者完成了题为“Lessons from the Cancer Genome”的文章,介绍了癌症基因组的系统性研究进展,概况了在细胞信号传导,染色体和表观遗传调控等方面发现的新癌基因Lander 教授是Broad医学院的创始人之一,人类基因组计划领导者之一
生物360 - Cell,癌症,基因组 - 2013-05-10
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