Nature子刊 | 全酶、无损的甲基化测序新方法“DM-Seq”,可以单碱基分辨率直接测序5mC
研究团队开发了一种仅使用酶的DNA甲基化测序新方法——“直接甲基化测序(DM-Seq)”。
测序中国 - DM-Seq,单碱基分辨率 - 2023-07-17
Nature子刊 | 多用途深度学习方法sciPENN,可预测、插补scRNA-seq、CITE-seq蛋白质表达
综上所述,研究团队开发了sciPENN深度学习模型,可以预测和估算蛋白质表达,集成多个CITE-seq数据集,量化预测和估算不确定性。
测序中国 - sciPENN,、插补scRNA-seq,CITE-seq蛋白质表达 - 2022-11-24
Nature子刊:多用途深度学习方法sciPENN,可预测、插补scRNA-seq、CITE-seq蛋白质表达
研究团队开发了sciPENN深度学习模型,可以预测和估算蛋白质表达,集成多个CITE-seq数据集,量化预测和估算不确定性。
测序中国 - 基因测序,深度学习 - 2022-11-24
DRCP: 治疗DM足BMMSC更优
糖尿病足 第三军医大学附属西南医院内分泌科陈兵教授等开展的一项随机对照研究提示,与骨髓单个核细胞(BMMNC)相比,骨髓间充质干细胞(BMMSC)治疗糖尿病严重下肢血供和足溃疡更有效,且耐受性更佳。(Diabetes Res Clin Pr.2011,92:26) 该研究纳入41例双下肢严重缺血和足溃疡的2型糖尿病患者,随机给予BMMNC、BMMSC或生理
糖尿病,骨髓间充质干细胞,MSC - 2011-06-13
Front Immunol:强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析
强直性脊柱炎(AS)是一种免疫介导的脊柱关节病。该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制,这将丰富AS单细胞研究的数据,为理解AS的发病机制提供新的视角。
MedSci原创 - 强直性脊柱炎,整合单细胞RNA-SEQ,ATAC-SEQ - 2022-02-19
SCI REP:利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染
近日,国际杂志 《SCI REP》在线发表一项关于利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染的研究。
MedSci原创 - 感染,细菌 - 2017-08-06
Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱
基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”,我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害,而且可能在生命后期导致严重疾病。然而,在此之前,调节性DNA序列一直很难发现。如今,在一项新的研究中,德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可
生物谷 - TT-Seq技术,人类瞬时转录 - 2016-06-04
Cardiovasc Diabetol:DM或非DM患者,BP-DES vs G2-DES的有效性和安全性
2018年8月,发表在《Cardiovasc Diabetol》的一项单中心研究调查了糖尿病患者或非糖尿病患者使用生物可降解高分子药物洗脱支架(BP-DESs)vs第二代药物洗脱支架(G2-DESs)的有效性和安全性。
环球医学 - DM,G2-DES,BP-DES - 2018-09-07
利用Perturb-Seq和CRISP-Seq大规模平行分析数以万计基因扰动
单细胞筛选:一种向导RNA(gRNA)文库---每个gRNA靶向一个独特的基因用于CRISPR干扰,并且携带一种独特的条形码序列---被导入一个细胞群体中,这个细胞群体的密度确保一个gRNA平均进入一个细胞中。单个细胞随后被分选到携带添加着独特条形码的polyT引物的液滴中,这些引物被用来提取细胞的mRNA。随后,对这些mRNA进行测序揭示出引入的基因突变(所引入的突变是由gRNA决
生物谷 - 基因扰动,CRISPR,Cas9,Perturb-Seq,CRISP-Seq,向导RNA,mRNA,条形码 - 2017-03-28
CLIP-seq—动物miRNA靶基因筛选新方法
CLIP-seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing),是一项在全基因组水平揭示
MedSci原创 - CLIP-seq,miRNA - 2014-01-10
基于RNA-Seq的长非编码RNA(lncRNA)预测
当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术,并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析,以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功
生物化学与生物物理学进展 - RNA-Seq,长非编码RNA - 2014-01-03
炎性肌病(PM/DM)诊断标准
炎性肌病(PM/DM)诊断标准 - 2022-09-26
Ophthalmology:青少年T1 DM或T2DM患者糖尿病视网膜病变的风险几何?
儿童和青少年2型糖尿病(T2DM)的发病率在不断增加。2017年4月,发表在《Ophthalmology》的一项研究调查了青年糖尿病患者糖尿病视网膜病变(DR)的风险因素,并比较了1型糖尿病(T1DM)与T2DM的DR率。
环球医学 - 糖尿病,视网膜 - 2017-04-26
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