Preprints: 利用对外源性RNA的转录反应预测RNA病毒的广谱抗病毒药
当与疫苗抗原同时接种时,病毒入侵是原核细胞和真核细胞所面临的最大挑战之一。对抗病毒感染的各种机制在所有生命形式中都得到了进化。
转化医学网 - 外源性RNA - 2020-03-31
Cell Rep:GW182 旁系同源或是RNA调节转录的关键
在细胞核中,小RNA也能控制转录和剪接。但是RNA介导的核调控机制尚不清楚,仍存在争议,阻碍了对核RNAi的有效应用及对其天然调控作用的深入研究。本研究中,研究人员发现,人类GW182旁系同源TNRC6A/B/C是RNA介导转录激活的关键因素。精核蛋白质朴分析再经实验验证表明,TNRC6A质谱与蛋白质相互作用,参与了蛋白质的降解,RNAi
MedSci原创 - GW182,转录 - 2017-09-09
Nature:RNA 修饰研究有助表观转录组学进一步发展
随着科研人员逐渐揭开 RNA 修饰的奥秘,帮助我们了解表观转录组学(epitranscriptomics)的工具也变得越来越多了。
生命奥秘/Eason - RNA修饰,转录组学 - 2017-03-21
Blood:增强子RNA ARIEL激活T-ALL的致癌性转录!
致癌性转录因子TAL1调控T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)的转录程序。ARID5B是TAL1下游的一个至关重要的靶点,其可进一步激活T-ALL细胞中的致癌调控回路。
MedSci原创 - 增强子RNA,ARIEL,T-ALL,致癌性转录 - 2019-05-13
Blood:单细胞RNA-seq可揭示非整倍体造血细胞的特异性转录本。
癌细胞常发生染色体异常。特定的细胞遗传变异常可用于预测结局,特别是对于血液肿瘤,例如常发生于恶性髓性血液病的7号染色体的单倍体。一直以来,由于缺乏将非整倍体细胞与二倍体细胞区分的标志物,很难在细胞水平研究非整倍体对功能的影响。
MedSci原创 - 单细胞RNA-seq,造血细胞,单倍体 - 2017-10-15
Blood:血小板和iPSC来源的巨核细胞的全基因组转录图谱和RNA测序
GWAS研究已经明确了与血小板相关表型相关的常见变异,但由于这些变异主要位于内含子中或基因间,它们与血小板生物学特征的相关性尚不清楚。
MedSci原创 - 血小板,巨核细胞,数量性状位点(eQTL) - 2020-11-02
Cell Res:北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止
中科院北京基因组研究所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文团队合作研究,发现 m6A 能稳定 R-loop 的形成,进而调控基因转录的有效终止。
北京基因所 - RNA,甲基化,R,-loop,形成 - 2019-10-15
Nature Methods:解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关
研究开发 SwitchSeeker 方法用于鉴定人类转录组中的 RNA 结构开关,在 RORC 转录本中验证,扩展对基因调控中 RNA 开关的理解,为未来研究奠定基础。
生物探索 - 基因调控,RNA结构开关,SwitchSeeker,人类转录组,RORC - 2024-07-18
ARCH PATHOL LAB MED:新一代RNA测序分析用于融合转录和致癌亚型的多重检测
下一代测序技术是一种高通量检测基因异常的方法,该技术的发展可为癌症患者提供预后和治疗信息。
MedSci原创 - 新一代RNA测序 - 2020-02-07
Nat Methods:何川团队开发RNA结合蛋白结合位点原位逆转录测序分析的新方法
该研究提出了一种基于逆转录的RBP结合位点测序(ARTR-seq)的检测方法,该方法依赖于抗体引导下RBP结合RNA的原位逆转录来识别RBP结合位点。
iNature - RNA结合蛋白,逆转录测序,RBP结合位点测序 - 2024-01-12
Curr Eye Res:HSV-1感染原代人角膜上皮细胞的长非编码RNA转录特征及整合分析
广州医科大学基础医学院附属第二医院心血管病研究所的Cui YH等近日在Curr Eye Res发表了一篇重要的研究论文,他们研究了HSV-1感染的原发性角膜上皮细胞中lncRNAs和mRNAs表达的全基因组图谱。
MedSci原创 - HSV-1,人角膜上皮细胞,长非编码RNA,转录特征,整合分析 - 2018-07-25
基于英国“10万人基因组计划”转录组数据,揭示RNA-seq对罕见疾病的诊断潜力
该研究对英国“十万人基因组计划”(UK100K)中一个大型患者队列的转录组数据进行了初步分析,揭示了RNA-seq在改善罕见疾病诊断方面的潜力。
测序中国 - RNA-Seq,RNA测序,罕见疾病 - 2023-06-28
PNAS:RNA结合蛋白DDX3介导雄激素受体的转录后调控:去势抗性的一个机制
雄激素受体(AR)驱动的前列腺癌(CaP)可以用雄激素阻断治疗;然而,治疗失败会导致致命的去势抗性前列腺癌(CRPC)。AR低/阴性(ARL/-)CRPC亚型最近被鉴定,且不能用激素疗法靶向治疗,最终
MedSci原创 - 前列腺癌,DDX3,转录调控 - 2020-11-09
Genome Biol:RNA印记法(RNA footprinting)用于转录组分析
生物学家们逐渐意识到,RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物,它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控,能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法,这一方法能够有效获得RNA与RNA结合蛋白(RBP)互作的所有位点。这一发表在Genome Biology杂志上的文章,不仅鉴定了RBP结合位点中的重要基因突变,还为其他RNA研究者提供了路线图。
MedSci原创 - 印记,RNA印记 - 2014-01-10
Proc Natl Acad Sci:吗啉代低聚物(MO)能改变疟疾的疟原虫的RNA转录,克服耐药
耶鲁大学的研究人员发现,改变疟原虫的基因表达可以抑制或减慢其在机体血液细胞中的生长,这一现象有可能抑制耐药菌株的出现。且该研究在美国国家科学院院刊得以提出和解释。全球范围内针对疟疾已经进行了巨大的努力,并耗费了国家庞大的财力 。它带给人们的打击是致命的和毁灭性的。在非洲,每年有近一百万5岁以下的儿童死于疟疾。在治疗疟疾的过程中,我们也发现了疟原虫对药物和杀虫剂会出现耐药性,这无疑对治疗过程带来了困
MedSci原创 - 疟原虫,RNA,耐药性 - 2015-09-09
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