Int J Cancer：病毒vs免疫功能不全时发生的癌症
2017-08-29 MedSci MedSci原创
免疫功能不全时，大多数由病毒引起的癌症会增加，但一些没有建立病毒病因学形式的癌症也有所增加，尤其是非黑色素瘤皮肤癌（non-melanoma skin carcinoma，NMSC）。来自瑞典的研究人员随访了13429例接受过实体器官移植的瑞典患者在移植后，癌症的发生情况。研究人员得到了他们的肿瘤标本，并对前89个标本进行了基因测序（62例非黑色素瘤皮肤癌，27例其他癌症）。使用两种生物信息学算法
免疫功能不全时，大多数由病毒引起的癌症会增加，但一些没有建立病毒病因学形式的癌症也有所增加，尤其是非黑色素瘤皮肤癌（non-melanoma skin carcinoma，NMSC）。来自瑞典的研究人员随访了13429例接受过实体器官移植的瑞典患者在移植后，癌症的发生情况。研究人员得到了他们的肿瘤标本，并对前89个标本进行了基因测序（62例非黑色素瘤皮肤癌，27例其他癌症）。使用两种生物信息学算法(paracel - blast(对已知病毒的检测敏感)和隐马尔可夫模型(HMM；对远亲病毒敏感）。在62例非黑色素瘤皮肤癌患者中，在标本中占最大比例的病毒家族是Mimiviridae（9/62 NMSC）。大多数的相关病毒属于乳头瘤病毒科（Papillomaviridae，又译作乳突病毒科）。对另外86个以前没有描述病毒序列的标本使用隐马尔可夫模型分析，发现了11个毒家族，最常见的是与Mimiviridae相关的（28/62 NMSC）；Mimivirus se906，1937 bp是最常见的序列，在17/62非黑色素瘤皮肤癌中被检测到。在其他27例癌症患者中，使用BLAST分析只有5例检测
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厉害了我的哥
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