与肺动脉重塑有关的新枢纽基因在肺动脉高压中的应用

研究背景：

肺动脉高压（PH）是一种威胁生命的疾病，发病机制复杂。根据病因，PH在临床分类中被分为五大类。然而，除了骨形态发生蛋白受体2型之外，肺动脉（PA）重塑是它们的共同特征；是否还有其他新的共同基因和类似的潜在机制，则难以捉摸。

研究方法：

为了确定不同PH组参与PA重塑的新的共同枢纽基因，我们利用生物信息技术分析了位于一般基因表达档案GSE130391中的mRNA-Seq数据。该数据库包含来自慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）、特发性肺动脉高压（IPAH）住院患者的不同PH组的PA样本，以及来自没有已知肺血管疾病的器官捐赠者的PA样本作为对照。

研究结果：

我们筛选了22个影响PA重塑的枢纽基因，其中大部分没有在PH中报道过。我们通过qRT-PCR验证了缺氧与Sugen诱导的PAH大鼠模型中的前10个常见枢纽基因。三个上调的候选基因是WASF1、ARHGEF1和RB1，七个下调的候选基因是IL1R1、RHOB、DAPK1、TNFAIP6、PKN1、PLOD2和MYOF。WASF1、ARHGEF1和RB1在缺氧与Sugen诱导的PAH中明显上调，而IL1R1、DAPK1和TNFA1P6在缺氧与Sugen诱导的PAH中明显上调。住院的PH患者通过mRNA-Seq检测到的DEGs与动物模型中的不同。这项研究将为进一步研究PH的机制和治疗提供一些新的目标基因。

研究结论：

本研究选择GSE130391芯片数据作为研究对象，包括没有已知肺血管疾病的器官捐赠者、IPAH患者和CTEPH患者的肺动脉基因芯片数据。首先，我们比较了IPAH和CTEPH的异同，筛选出它们的共同DEGs。此外，利用Sugen诱导的PAH（第1组）的缺氧情况对筛选出的共同DEGs进行了验证。

参考文献：

Tan R, You Q, Yu D, Xiao C, Adu-Amankwaah J, Cui J, Zhang T. Novel hub genes associated with pulmonary artery remodeling in pulmonary hypertension. Front Cardiovasc Med. 2022 Nov 30;9:945854. doi: 10.3389/fcvm.2022.945854. PMID: 36531719; PMCID: PMC9748075.