NCAPG促进肺动脉平滑肌细胞增殖是特发性肺动脉高压的一个有前途的治疗目标
2022-10-17 刘少飞 MedSci原创
通过体内和体外实验,最终确定NCAPG为IPAH的潜在治疗靶点,为临床工作提供了一个新的治疗思路。
肺动脉高压(PAH)是由各种原因引起的肺血管结构或功能改变,导致肺血管阻力和肺动脉压力增加,最终导致右心衰竭甚至死亡的一种临床综合征。在世界范围内,PAH的发病率高达每百万成人7.6例,发病率为每百万成人26至100例。特发性肺动脉高压(IPAH)是一种具有复杂病因的疾病。目前,IPAH的治疗是有限的,患者的预后也很差。
在肿瘤学领域,利用微阵列和高通量测序技术来预测疾病的潜在靶点已经非常成熟。近年来,这种方法也被用于检测PAH患者、动物或细胞样本,分析和筛选相应的基因治疗靶点。Gene Expression Omnibus(GEO)数据库提供了多组IPAH组织或细胞的基因表达微阵列数据。利用生物信息学分析方法可以帮助我们筛选与IPAH发病机制相关的潜在基因,为靶向治疗提供一定的指导。Bai Z等人通过使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)算法,发现了与PAH相关的两个中心基因ECM2和GLT8D2。Lin W等人通过Robust Rank Aggregation(RRA)方法和实验发现TXNRD1作为IPAH的新型生物标志物和潜在治疗靶点。但是,目前的一些研究存在着只做理论预测,而没有通过实验进一步验证其预测结果的可靠性的缺点。
本研究旨在通过生物信息学探索IPAH的新治疗目标。从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获得了符合要求的两个数据集(GSE113439和GSE130391)。然后,通过NetworkAnalyst平台对差异表达基因(DEGs)进行鉴定和分析。通过GO和京都基因和基因组百科全书(KEGG),我们检查了DEGs的功能。
利用CytoNCA插件构建了一个蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络以确定中心基因。最后,筛选出四个中心基因:ASPM、CENPE、NCAPG和TOP2A。我们选择NCAPG进行蛋白水平的验证。我们建立了PAH的动物模型,发现NCAPG在PAH大鼠的肺部组织中表达明显增加。体外实验显示,NCAPG在增生的肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)中的表达明显增加。当PASMCs的NCAPG被敲除后,细胞增殖受到抑制,这表明NCAPG与PASMCs的增殖有关。因此,这些结果可能为IPAH提供新的治疗目标。
参考文献:
Fu B, Li Y, Shi X, Liu P, Zhang Y, Tian H. NCAPG Promotes Pulmonary Artery Smooth Muscle Cell Proliferation as a Promising Therapeutic Target of Idiopathic Pulmonary Hypertension: Bioinformatics Analysis and Experiment Verification. Int J Mol Sci. 2022 Oct 4;23(19):11762. doi: 10.3390/ijms231911762. PMID: 36233060.
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