2024 ASH｜Andean富集NFKB1单倍型有助于减轻PV和ET患者的炎症反应，并提高其对罗培干扰素α-2b的反应

慢性炎症是真性红细胞增多症（PV）、原发性血小板增多症（ET）以及其他骨髓增殖性肿瘤（MPNs）的一个特征。核因子κB（NF-κB）在调节促炎细胞因子中起着关键作用。在PV和ET中，NF-κB通路的激活是炎症的主要驱动因素，增强了缺氧诱导因子（HIFs）的活性，增加了促血栓基因的转录。抑制NF-κB通路已被证明可以减轻MPNs的疾病负担（Laranjeira, Blood, 2024）。

我们通过使用来自玻利维亚拉巴斯的Aymara人和欧洲人的中性粒细胞转录组数据，研究了安第斯土著居民Aymara人血红蛋白升高的遗传基础。我们发现他们的差异表达和剪接基因与炎症和HIFs通路相关。我们鉴定了Aymara人中三种新的选择性剪接NFKB1转录本（AS-NFKB1），它们分别跳过了第4、第5外显子或两者都有。跳过第5外显子的AS-NFKB1转录本被翻译成蛋白质，但显示核定位缺陷，而其他两种AS-NFKB1转录本没有被翻译，表明NFKB1作为NF-κB抑制因子的功能部分或完全丧失。AS-NFKB1还增强了HIFs的活性，解释了Aymara人血红蛋白水平较高的原因。通过全基因组测序和中性粒细胞转录组的综合分析，我们鉴定了与AS-NFKB1相关的剪接数量性状位点；NFKB1 rs230511与高AS-NFKB1表达相关。其T等位基因（C/T或T/T基因型）在Aymara人中约占90%，但也存在于约30%的欧洲人、西班牙人和亚洲人中。在TNF诱导的炎症应激下，与野生型NFKB1不同，AS-NFKB1抑制了炎症基因的表达，表明这是一种抗炎保护机制（待审查，Nature Communication）。

因此，我们检验了NFKB1 rs230511与PV和ET中炎症标志物以及对罗普司亭α-2b（Ropeg）治疗的反应之间的关联。我们对30名PV患者和15名ET患者进行了基因分型，评估了中性粒细胞和血小板中炎症基因表达（IL1B、CXCL8、IL6、IL15和TNF）。在血小板中，C/T基因型个体的这些炎症转录本水平低于C/C基因型个体，IL1B、CXCL8和TNF水平在T/T基因型中也降低。在中性粒细胞中，T/T基因型中IL1B和CXCL8降低，而IL15和TNF水平在C/T基因型中降低。

鉴于AS-NFKB1和NFKB1 rs230511与HIFs的转录活性升高相关，我们分析了HIF靶基因的表达。在PV和ET的中性粒细胞和血小板中，LDHA、SLC2A1和VEGFA转录本在C/T基因型中显著降低。由于炎症和HIF转录活性增加与PV和ET中的血栓形成相关（Gangaraju, Blood Advances, 2020），我们还测量了促血栓基因（F3、THBD、SELP、SERPINE1）的表达水平。在血小板和粒细胞中，C/T基因型个体的F3和THBD转录本水平显著低于C/C基因型个体。

罗普司亭通过干扰素信号调节炎症，并攻击PV和ET克隆（Verger, Blood Cancer J., 2018）。我们发现C/T基因型（58.6%）在达到完全血液学反应（CHR）的患者中比非CHR队列（包括未达到CHR或有细胞减少的患者）更为普遍，后者为33.3%（p<0.0001）。这一发现也与CHR组相比非CHR组炎症、HIF靶标和血栓形成基因的转录水平较低相关。

我们的研究表明，与NFKB1野生等位基因相比，Aymara富集的NFKB1 rs230511单倍型降低了PV和ET的炎症、促血栓和HIF活性。NFKB1 rs230511单倍型还调节了PV和ET对罗普司亭的反应。NFKB1 rs230511 T等位基因的存在与炎症和HIF靶标基因的表达降低相关，可能降低了PV和ET中炎症和血栓形成的风险。C/T基因型的患者更有可能达到CHR，表明这种NFKB1单倍型可能影响罗普司亭治疗的疗效，并可作为PV和ET患者反应评估的潜在生物标志物。这些新见解为我们理解炎症和促血栓过程提供了宝贵的启示，并可能导致PV和ET的新疗法。