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Sci Rep :临床标本中梅毒螺旋体Nichols样菌株的高频率和大环内酯类耐药性的增加

2022-10-25 医路坦克 MedSci原创

背景:

背景:梅毒(TPA)是导致梅毒(一种人类慢性性病)的梅毒螺旋体亚种细菌病原体。尽管有多种诊断工具和有效的青霉素治疗,梅毒在世界范围内的患病率和发病率仍然很高。世界卫生组织估计,2020年全球约有2230万年龄在15至49岁之间的人患有梅毒,全球每年新增710万例梅毒病例,美洲地区新增110万例。

在阿根廷,梅毒发病率自2010年以来一直稳步上升,从2015年的每100,000名居民21.2例新增病例增加到2019年的每100,000名居民56.1例,2019年每1000名活产婴儿1.55例先天性梅毒。几项流行病学研究已经确定了特别容易感染梅毒的群体,如男男性行为者、女性性工作者和变性者,梅毒患病率在17%至50%之间

目的:本研究的目的是通过分析2015-2019年期间收集的TPA临床菌株的菌株和单倍型分布以及抗生素耐药性相关突变的存在来描述布宜诺斯艾利斯的梅毒流行特征,以便使用较新的MLST方法更新和扩展我们以前的报告。

方法:在2015-2019年期间收集了疑似梅毒患者的拭子样本,并对位点TP0136、TP0548、TP0705进行测序,以进行多位点序列分型。菌株被分类为Nichols样或SS14样。通过检测23S rDNA基因序列来确定大环内酯类耐药相关突变的存在。

结果:在46个可分型样本中,37%被归类为Nichols样,63%被归类为SS14样。大环内酯类耐药率为45.7%。发现了七个等位基因图谱,五个是SS14样的,两个是Nichols样的。Nichols样菌株的频率在研究之间增加(26.8%比37%,p = 0.36)。在不同的研究中,大环内酯类药物耐药菌株的出现频率显著增加(14.3%对45.7%,p = 0.005)。

表1 2015-2019年在布宜诺斯艾利斯的一家性传播感染诊所就诊的患者的34份完全分型和12份部分分型病变拭子样本的MLST等位基因谱。a根据梅毒螺旋体病亚种公共数据库。苍白球15。b等位基因图谱基于三个数字代码:第一个数字对应于TP0136基因座的等位基因变体,第二个对应于TP0548基因座的等位基因变体,第三个对应于TP0705基因座的等位基因变体。我们用X表示等位基因变异未确定。c S 23S rDNA无突变(敏感),R8 23S rDNA a 2058g突变(抗性),R9 a 2059g 23S rDNA突变(抗性),X未确定。每个案例的频率(数量)在括号中给出。d根据定型样本总数计算的百分比(完全定型样本数+部分定型样本数)。新鉴定的等位基因谱,带有以前研究中已知的等位基因。

图1 在全类型样品中鉴定的串联TP0136、TP0548和TP0705序列上进行的1000个引导复制的多数规则共识树。对于支持度超过50%的进化枝,给出了引导百分比。刻度显示了每个位点的置换数。自举值显示在分支旁边。串联序列的长度为1901 bp,包含44个可变位置。该树是在MEGA X中使用带有自举测试的最大似然法构建的

表3。本研究与在其他大陆进行的研究之间报告的TPA等位基因频率的比较。a根据公共数据库15的数据。只有全型菌株的频率用于计算。

表2不同研究中clade和大环内酯类药物耐药频率的比较。重要值以粗体显示。

结论:我们的结果与国际趋势一致,并强调了在南美进行进一步TPA分子分型研究的必要性。

原文出处:Morando N,  Vrbová E,  Melgar A, et al.High frequency of Nichols-like strains and increased levels of macrolide resistance in Treponema pallidum in clinical samples from Buenos Aires, Argentina.Sci Rep 2022 Sep 29;12(1) 

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