HLA：新的HLA-DQB1*03:02:01:14等位基因可能是由重组事件产生

人类白细胞抗原（Human Leukocyte Antigen, HLA）是人类的主要组织相容性复合体（MHC），位于6号染色体上（6p21.31），包括一系列紧密连锁的基因座，是人类基因中多态性最多的基因。这种极端多态性的产生涉及的遗传机制包括重组、基因转换和点突变。目前可以通过下一代测序(NGS)进行HLA高分辨率分型，可以生成完整或几乎完整的HLA基因的分阶段序列，从而表征HLA多态性并增加对其产生的遗传机制的理解。

2023年5月1日发表在HLA的文章描述了一种新的HLA-DQB1等位基因，一种可能由重组事件产生的HLA-DQB1*03:02:01等位基因的变体。

在一名男性志愿者骨髓供者中通过NGS进行常规HLA分型鉴定。使用NGSgo®-MX11-3和MiniSeq平台对NGS方案进行两次评估。数据采用NGSengine®软件和IPD-IMGT/HLA数据库3.49版进行分析。

将新发现的DQB1*03:02:01:14等位基因部分核苷酸序列与最近的DQB1*03:02:01:11等位基因及相关序列(DQB1*03:02:01:01和DQB1*03:03:02:01)比对

志愿者骨髓供者的完整高分辨率HLA分型(包括新等位基因)如下：HLA-a*01:01:01，11:01:01；-b*08:01:01 35:02:01；-c*04:01:01 07:01:01；-DRB1*09:01:02 13:02:01；-DRB3*03:01P；-DRB4*01:03:02；-DQA1*01:02:01 03:02:01:01；-DQB1*03:02:01:14 06:09:01:01；-DPA1*01:03:01−；-DPB1*02:01:02 04:01:01。

HLA-DQB1单期全基因组分析后，测序结果为DQB106:09:01:01和DQB103var。将DQB103var分组在DQB103:02 2p中，与DQB1*03:02:01:11等位基因相关的非编码区有4个核苷酸变化，第1内含子区有1个，第2内含子区有3个。内含子1的变化位于基因组位置577 (A > G)，在内含子2中发现的三个单核苷酸变化位于基因组位置2155(A>G)，3466 (A>G)和3933(T>C)。

新等位基因的核苷酸序列已提交给GenBank数据库（登录号:ON817173），并可在IPD-IMGT/HLA数据库中获取，登录号：HLA35562（提交号:HWS10061984）。DQB1*03:02:01:14于2022年7月被世界卫生组织(WHO) HLA系统因子命名委员会正式命名。遵循双方商定的政策，即根据最新命名法报告中规定的条件，6个名称将被分配给新序列。这些新名称的清单将在下面的世卫组织命名法报告中公布。

当DQB103:02:01:14序列与IPD-IMGT/HLA数据库中包含的所有HLA-DQB1等位基因比对时，研究人员注意到所有报道的第一和第二内含子区域的错配都与5个DQB103:02:01:01等位基因共有，其中DQB103:02:01:01最为常见。然而DQB103:02:01:14从内含子3到内含子5，相对于DQB103:02:01:01有10个核苷酸变化。这10种错配与DQB103:02:01:11和DQB103:03:02:01共有。由于DQB103:02:01:11只在印度女性中检测到一次，所以DQB103:02:01:14的起源最可能的解释是DQB103:02:01:01和DQB1*03:03:02:01之间的重组导致的。

原始出处

Niño Ramírez, JE, Gil-Etayo, FJ, Jiménez Hernaz, I, García Sanz, R, Tejeda Velarde, A. The novel HLA-DQB1*03:02:01:14 allele was possibly generated by a recombination event. HLA. 2023; 1- 3. doi:10.1111/tan.15051